24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0226 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0226  TM2  100 
 
 		 201 aa  395  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.162591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  50.5 
 
 		 336 aa  87.4  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  34.18 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03530  predicted membrane protein  35.86 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0851449 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01500  predicted membrane protein  41 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0837  TM2 domain-containing protein  37 
 
 		 92 aa  72  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27311  hypothetical protein  38.18 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.848779 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0382  hypothetical protein  41.82 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1506  TM2 domain containing protein  45.71 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0888  TM2 domain-containing protein  35 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0836  TM2 domain-containing protein  38.38 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0353  hypothetical protein  34.62 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000372967  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  38.14 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1814  hypothetical protein  35.64 
 
 		 91 aa  57.8  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1547  hypothetical protein  36 
 
 		 91 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0248034 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  34.19 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  32 
 
 		 107 aa  51.6  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  31.9 
 
 		 107 aa  50.1  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  32.28 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  35.05 
 
 		 253 aa  49.7  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  33.05 
 
 		 107 aa  48.9  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2984  TM2 domain containing protein  35.9 
 
 		 305 aa  45.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  32 
 
 		 131 aa  42.4  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  34.31 
 
 		 137 aa  42  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.134509 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>