30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0353 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0353  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  361  2e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000372967  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  45.65 
 
 
336 aa  72.4  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  41.84 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0888  TM2 domain-containing protein  40.91 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03530  predicted membrane protein  33.33 
 
 
159 aa  63.5  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0851449 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2984  TM2 domain containing protein  39.13 
 
 
305 aa  62.8  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  34.96 
 
 
212 aa  63.2  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01500  predicted membrane protein  39.08 
 
 
265 aa  58.9  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0226  TM2  28.36 
 
 
201 aa  57.4  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.162591  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0837  TM2 domain-containing protein  37.93 
 
 
92 aa  57  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0836  TM2 domain-containing protein  47.13 
 
 
79 aa  55.1  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  37.97 
 
 
99 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  39.74 
 
 
116 aa  52  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27311  hypothetical protein  36.47 
 
 
92 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.848779 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  34.17 
 
 
190 aa  49.7  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  35.29 
 
 
161 aa  48.9  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  35.58 
 
 
109 aa  47  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1506  TM2 domain containing protein  41.05 
 
 
87 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  29.84 
 
 
137 aa  45.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0382  hypothetical protein  37.5 
 
 
88 aa  44.7  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0660  hypothetical protein  46.15 
 
 
128 aa  44.7  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1304  hypothetical protein  25.24 
 
 
261 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0975  TM2 domain containing protein  40.74 
 
 
252 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0948  TM2 domain containing protein  40.74 
 
 
252 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3666  TM2 domain containing protein  30.95 
 
 
160 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1899  TM2 domain-containing protein  43.94 
 
 
155 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.47053  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1148  hypothetical protein  23.3 
 
 
261 aa  42.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1369  hypothetical protein  24.27 
 
 
261 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  34.15 
 
 
131 aa  42  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2649  TM2 domain containing protein  29.59 
 
 
100 aa  41.6  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>