More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1399 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1399  N-terminal methylation  100 
 
 		 69 aa  140  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.427035 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  69.57 
 
 		 70 aa  101  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1496  pilin domain-containing protein  79.41 
 
 		 90 aa  87.8  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232938  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1656  pilin domain-containing protein  76.47 
 
 		 74 aa  85.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000269442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1636  pilin domain-containing protein  76.47 
 
 		 74 aa  84.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2590  pilin domain protein  73.53 
 
 		 76 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2677  hypothetical protein  70.15 
 
 		 203 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2144  pilus-related protein, putative  66.18 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  59.68 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  47.69 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  46.97 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  46.97 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.23 
 
 		 157 aa  63.5  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  55.74 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  49.21 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0126  Tfp pilus assembly protein PilE-like  49.21 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0148502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  48.44 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  48.33 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  43.08 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  45.16 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  44.62 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  43.55 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  35.82 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  51.67 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  45.76 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  47.62 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1559  N-terminal methylation domain-containing protein  47.37 
 
 		 186 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.989333  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  41.18 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  43.48 
 
 		 179 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  55.1 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  47.62 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1109  hypothetical protein  43.33 
 
 		 153 aa  57  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  47.46 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  45.16 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  56.6 
 
 		 158 aa  57  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  44.44 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  40 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  40.32 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  45 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1042  hypothetical protein  43.33 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  52.24 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  72.22 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  38.1 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  52.24 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  42.86 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1599  N-terminal methylation domain-containing protein  45.61 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.56 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  43.75 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  39.06 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0414  methylation site containing protein  58.7 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  41.27 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  50.94 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.61 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.52 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  46.03 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  44.62 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.46 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.18 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  71.88 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2564  hypothetical protein  45.16 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569226 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  61.9 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3549  type 4 prepilin-like protein  45.16 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  41.94 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  37.7 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  40.58 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  37.7 
 
 		 323 aa  53.9  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1170  xcmT3  42.19 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  34.33 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  40.98 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  70.59 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2019  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.19 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3736  hypothetical protein  46.67 
 
 		 219 aa  53.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  57.45 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  39.06 
 
 		 150 aa  52.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.7 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  31.34 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  38.98 
 
 		 324 aa  52.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  61.9 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  64.86 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  50.98 
 
 		 137 aa  52.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3175  Fimbrial protein pilin  43.64 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  39.06 
 
 		 150 aa  52.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  39.06 
 
 		 150 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.7 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  36.92 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  35.94 
 
 		 330 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  32.84 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  39.06 
 
 		 150 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  50 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  39.06 
 
 		 150 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  61.7 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  40.98 
 
 		 146 aa  52.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  43.33 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  37.88 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  53.06 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  40.91 
 
 		 145 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>