More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1496 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1496  pilin domain-containing protein  100 
 
 		 90 aa  183  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232938  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  80.88 
 
 		 70 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1656  pilin domain-containing protein  80 
 
 		 74 aa  94  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000269442  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1399  N-terminal methylation  79.41 
 
 		 69 aa  88.2  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.427035 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1636  pilin domain-containing protein  79.41 
 
 		 74 aa  87.8  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2590  pilin domain protein  79.41 
 
 		 76 aa  85.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2677  hypothetical protein  67.16 
 
 		 203 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  50.82 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  52.38 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2144  pilus-related protein, putative  66.18 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  48.48 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  47.76 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  47.69 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  46.97 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50.79 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  44.26 
 
 		 132 aa  62  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  48.44 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  46.38 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  70.21 
 
 		 188 aa  60.5  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2153  competence protein  40.62 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0605499  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  43.24 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  54.72 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  42.19 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  59.32 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  43.48 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  37.68 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50.79 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  35.82 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  48.57 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  49.15 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  47.46 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  46.48 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  40.62 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  44.12 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  46.77 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  46.27 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0414  methylation site containing protein  41.67 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1042  hypothetical protein  52.83 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  53.7 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  44.12 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  40.91 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  46.03 
 
 		 182 aa  57.4  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  42.31 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1172  hypothetical protein  42.19 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123806  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004288  putative fimbrial assembly protein PilE  32.93 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  72.22 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  39.44 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  46.77 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  44.44 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  39.74 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1142  general secretion  42.86 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000033549  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  54.9 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  41.94 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  40.91 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  46.67 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  69.44 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  37.31 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  66.67 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  37.31 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  41.27 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  34.85 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  40.68 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0126  Tfp pilus assembly protein PilE-like  64.86 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0148502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1319  secretory protein  38.81 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0113151 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  42.65 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.62 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  39.39 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  64.29 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  43.94 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  57.14 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  55.36 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  37.31 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  61.22 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  44.44 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  37.31 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  48.28 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  40.98 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  42.42 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  42.86 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  37.31 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  37.31 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  44.44 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  69.44 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  54.9 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2895  general secretion pathway protein G  36.9 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.62 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  85.71 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  44.44 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  46.3 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  49.15 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  54 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  44.26 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.62 
 
 		 163 aa  53.5  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  49.15 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  39.39 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  36.51 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  62.16 
 
 		 179 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  50 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  50.94 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  35.82 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>