31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_11420 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_11420  predicted membrane protein  100 
 
 		 71 aa  144  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1298  TM2 domain-containing protein  52.31 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1273  TM2 domain-containing protein  52.31 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0780  hypothetical protein  55.17 
 
 		 67 aa  80.1  0.000000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0660  hypothetical protein  59.65 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2649  TM2 domain containing protein  53.12 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  49.21 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2773  hypothetical protein  50 
 
 		 247 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.00177e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0289  hypothetical protein  51.02 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0163105 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1098  TM2 domain-containing protein  47.62 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000223693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1121  TM2 domain-containing protein  47.62 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000186837  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0975  TM2 domain containing protein  41.51 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0948  TM2 domain containing protein  41.51 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  54 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0828  TM2 domain containing protein  40.91 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0624  hypothetical protein  56.1 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.317815  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1421  TM2 domain containing protein  66.67 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0216087  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4098  TM2 domain-containing protein  40 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3752  TM2 domain-containing protein  48.08 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3393  TM2 domain-containing protein  38.18 
 
 		 113 aa  47.4  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  45.76 
 
 		 253 aa  45.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01500  predicted membrane protein  37.14 
 
 		 265 aa  44.3  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0837  TM2 domain-containing protein  43.33 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  39.66 
 
 		 336 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  36.99 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0612  hypothetical protein  41.51 
 
 		 53 aa  43.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2984  TM2 domain containing protein  36.71 
 
 		 305 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1224  TM2 domain-containing protein  39.53 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0929  hypothetical protein  37.21 
 
 		 124 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  50 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  44.64 
 
 		 131 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>