38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2397 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2397  TM2 domain containing protein  100 
 
 		 113 aa  235  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.25927e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2756  TM2 domain containing protein  49.28 
 
 		 67 aa  67.8  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000265887  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3876  TM2 domain containing protein  53.03 
 
 		 78 aa  64.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2746  TM2 domain containing protein  51.56 
 
 		 67 aa  64.7  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000224877  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1541  TM2 domain containing protein  41.79 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273114  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2773  hypothetical protein  37.23 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.00177e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  35.79 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  34.95 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4904  TM2 domain-containing protein  45.61 
 
 		 176 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4067  TM2 domain containing protein  47.73 
 
 		 469 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  35.79 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17940  predicted membrane protein  33.85 
 
 		 344 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.300515  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  42.11 
 
 		 194 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0480  TM2  57.14 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.748725  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5043  hypothetical protein  54.29 
 
 		 184 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307475  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2502  TM2  55.81 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000265771  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5141  TM2 domain-containing protein  55.81 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0374  TM2 domain-containing protein  53.49 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5091  hypothetical protein  53.49 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.710135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03100  TM2 domain-containing hypothetical protein  51.43 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.564885  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4964  TM2 domain-containing protein  52.94 
 
 		 139 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0289  hypothetical protein  32.5 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0163105 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  38.71 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1622  hypothetical protein  51.43 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53630  hypothetical protein  45 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142273  hitchhiker  0.000532666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4937  TM2 domain containing protein  44.12 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5316  TM2  48.84 
 
 		 144 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4699  hypothetical protein  45 
 
 		 111 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0167  TM2 domain-containing protein  51.43 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  38.1 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4145  TM2 domain-containing protein  51.43 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1652  TM2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.503869  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  28.33 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0299  TM2 domain containing protein  50 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000251621  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1089  TM2  43.48 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05210  hypothetical protein  55.88 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0498  hypothetical protein  52.94 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>