31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2649 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2649  TM2 domain containing protein  100 
 
 
100 aa  206  8e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0660  hypothetical protein  57.97 
 
 
128 aa  79  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0780  hypothetical protein  56.67 
 
 
67 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11420  predicted membrane protein  53.12 
 
 
71 aa  71.6  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45156  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1298  TM2 domain-containing protein  48.61 
 
 
92 aa  70.1  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1273  TM2 domain-containing protein  48.61 
 
 
92 aa  70.1  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  55.77 
 
 
99 aa  62  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  49.09 
 
 
116 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2773  hypothetical protein  51.79 
 
 
247 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.00177e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1098  TM2 domain-containing protein  47.54 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000223693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1121  TM2 domain-containing protein  47.54 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000186837  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1421  TM2 domain containing protein  63.16 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0216087  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0289  hypothetical protein  58.14 
 
 
118 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0163105 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0624  hypothetical protein  51.22 
 
 
71 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.317815  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0975  TM2 domain containing protein  31.15 
 
 
252 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0948  TM2 domain containing protein  31.15 
 
 
252 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0612  hypothetical protein  53.33 
 
 
53 aa  46.2  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1224  TM2 domain-containing protein  45 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4098  TM2 domain-containing protein  40 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3393  TM2 domain-containing protein  40 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0929  hypothetical protein  50 
 
 
124 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  43.94 
 
 
336 aa  44.3  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  39.19 
 
 
190 aa  43.9  0.0008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3752  TM2 domain-containing protein  36.92 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2689  hypothetical protein  42.86 
 
 
366 aa  41.2  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.045764  normal  0.072114 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  42.19 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0353  hypothetical protein  38.89 
 
 
181 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000372967  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2984  TM2 domain containing protein  39.19 
 
 
305 aa  40.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  35.48 
 
 
212 aa  40.4  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0837  TM2 domain-containing protein  38.16 
 
 
92 aa  40.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0828  TM2 domain containing protein  35.29 
 
 
265 aa  40  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>