24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1298 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1298  TM2 domain-containing protein  100 
 
 
92 aa  187  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1273  TM2 domain-containing protein  100 
 
 
92 aa  187  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0780  hypothetical protein  77.61 
 
 
67 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11420  predicted membrane protein  52.31 
 
 
71 aa  85.5  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45156  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0660  hypothetical protein  53.33 
 
 
128 aa  84.3  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1121  TM2 domain-containing protein  57.58 
 
 
71 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000186837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1098  TM2 domain-containing protein  57.58 
 
 
71 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000223693  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0624  hypothetical protein  60.29 
 
 
71 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.317815  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2649  TM2 domain containing protein  48.61 
 
 
100 aa  70.1  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  51.72 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2773  hypothetical protein  47.46 
 
 
247 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.00177e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  49.18 
 
 
99 aa  60.8  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0948  TM2 domain containing protein  43.28 
 
 
252 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0975  TM2 domain containing protein  43.28 
 
 
252 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0828  TM2 domain containing protein  42 
 
 
265 aa  52.4  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0289  hypothetical protein  55.26 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0163105 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4098  TM2 domain-containing protein  38.46 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3393  TM2 domain-containing protein  36.54 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0612  hypothetical protein  47.06 
 
 
53 aa  47.4  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  37.31 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3752  TM2 domain-containing protein  36.54 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2984  TM2 domain containing protein  47.83 
 
 
305 aa  41.2  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4395  hypothetical protein  45.61 
 
 
132 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0941957 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1224  TM2 domain-containing protein  44.12 
 
 
125 aa  40  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>