18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4395 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4395  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  268  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0941957 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0601  hypothetical protein  57.14 
 
 
135 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0616  hypothetical protein  56.39 
 
 
135 aa  159  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.460301  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0929  hypothetical protein  56.59 
 
 
124 aa  142  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1224  TM2 domain-containing protein  55.81 
 
 
125 aa  141  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4736  hypothetical protein  49.24 
 
 
128 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0156129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0948  TM2 domain containing protein  35.25 
 
 
252 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0975  TM2 domain containing protein  35.25 
 
 
252 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0828  TM2 domain containing protein  38.46 
 
 
265 aa  53.9  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0289  hypothetical protein  42.86 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0163105 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  48.89 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3752  TM2 domain-containing protein  38.81 
 
 
97 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5817  hypothetical protein  44.74 
 
 
254 aa  40.8  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.142716  decreased coverage  0.00443315 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4098  TM2 domain-containing protein  41.38 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3393  TM2 domain-containing protein  41.38 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1298  TM2 domain-containing protein  45.61 
 
 
92 aa  40.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1273  TM2 domain-containing protein  45.61 
 
 
92 aa  40.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  36.11 
 
 
99 aa  40.4  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>