12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0601 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0601  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  275  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0616  hypothetical protein  99.26 
 
 
135 aa  273  6e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.460301  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4395  hypothetical protein  57.14 
 
 
132 aa  161  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0941957 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0929  hypothetical protein  54.55 
 
 
124 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1224  TM2 domain-containing protein  50 
 
 
125 aa  132  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4736  hypothetical protein  46.62 
 
 
128 aa  113  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0156129 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0828  TM2 domain containing protein  33.8 
 
 
265 aa  50.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0948  TM2 domain containing protein  28 
 
 
252 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0975  TM2 domain containing protein  28 
 
 
252 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  33.33 
 
 
116 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0289  hypothetical protein  42 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0163105 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  27.41 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>