61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_22480 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_22480  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  672    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.606654 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  35.25 
 
 		 6678 aa  62.8  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04540  sporulation related protein  33.86 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000449317 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  31.25 
 
 		 2003 aa  60.5  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.53 
 
 		 594 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.94 
 
 		 652 aa  57.8  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  38.39 
 
 		 658 aa  56.2  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  43.94 
 
 		 651 aa  55.5  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4130  C-type lectin domain protein  31.58 
 
 		 186 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  34.15 
 
 		 691 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  33.75 
 
 		 662 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2045  PASTA domain containing protein  28.72 
 
 		 330 aa  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.74 
 
 		 584 aa  50.8  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4091  C-type lectin domain protein  30.53 
 
 		 186 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  37.8 
 
 		 4379 aa  50.1  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  33.85 
 
 		 666 aa  49.7  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  32.31 
 
 		 664 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  32.31 
 
 		 664 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  45.45 
 
 		 582 aa  48.1  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2230  PASTA domain-containing protein  37.14 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.81 
 
 		 645 aa  47.8  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2392  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.62 
 
 		 702 aa  47.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00165759  hitchhiker  0.000838349 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  35.71 
 
 		 692 aa  47  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22530  hypothetical protein  30.83 
 
 		 395 aa  47  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.576293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  36.84 
 
 		 618 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16420  F5/8 type C domain-containing protein  28.83 
 
 		 322 aa  46.6  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.504791 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21970  hypothetical protein  45.95 
 
 		 400 aa  46.6  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000547844  hitchhiker  0.00670198 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  40.32 
 
 		 612 aa  46.6  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  29.35 
 
 		 646 aa  46.2  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26200  hypothetical protein  47.73 
 
 		 312 aa  46.2  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.987392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  40.68 
 
 		 666 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.7 
 
 		 598 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0744  PASTA domain-containing protein  32.81 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.947966  hitchhiker  0.000000811386 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.4 
 
 		 647 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172256  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0112  hypothetical protein  56 
 
 		 389 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00718309  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.64 
 
 		 681 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  35.38 
 
 		 614 aa  45.1  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26350  hypothetical protein  26.37 
 
 		 794 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00144555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  30.99 
 
 		 597 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  35.87 
 
 		 623 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4788  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.97 
 
 		 723 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0271  FHA domain containing protein  46 
 
 		 239 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.373949 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06660  hypothetical protein  44.44 
 
 		 386 aa  43.9  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.100773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  37.88 
 
 		 736 aa  44.3  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.48 
 
 		 693 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  39.71 
 
 		 661 aa  43.9  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.62 
 
 		 707 aa  43.5  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0294  serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 		 757 aa  43.5  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0633635  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02160  hypothetical protein  32.32 
 
 		 272 aa  43.1  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 		 636 aa  43.5  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1975  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  42.65 
 
 		 673 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0962  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  43.5  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.915244  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  35.29 
 
 		 615 aa  43.1  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.26 
 
 		 676 aa  42.7  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.82 
 
 		 658 aa  42.7  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0371  PASTA domain containing protein  29.84 
 
 		 530 aa  42.7  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.383878  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  34.33 
 
 		 641 aa  42.7  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0114  hypothetical protein  52 
 
 		 390 aa  42.7  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.68 
 
 		 718 aa  42.7  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581309  hitchhiker  0.000240605 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.62 
 
 		 627 aa  42.7  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0940  lectin C-type domain-containing protein  30.61 
 
 		 730 aa  42.7  0.01  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00780626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>