15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0982 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0982  putative transcriptional regulator, CopG family  100 
 
 
246 aa  505  9.999999999999999e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.01357  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2825  hypothetical protein  48.16 
 
 
204 aa  191  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0525  hypothetical protein  39.84 
 
 
198 aa  160  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.497399  normal  0.602099 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2408  hypothetical protein  41.39 
 
 
178 aa  158  9e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0167  hypothetical protein  41.8 
 
 
197 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  36.54 
 
 
351 aa  45.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0435  hypothetical protein  35.48 
 
 
288 aa  44.3  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  39.13 
 
 
806 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  33.77 
 
 
376 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  31.11 
 
 
406 aa  43.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  38.89 
 
 
325 aa  42.4  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11760  hypothetical protein  35.56 
 
 
157 aa  42.4  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.032321 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0646  hypothetical protein  37.5 
 
 
110 aa  42  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  37.5 
 
 
380 aa  42.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3718  hypothetical protein  40 
 
 
169 aa  42  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431162 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>