35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_11760 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_11760  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  322  1e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.032321 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1908  hypothetical protein  71.97 
 
 
183 aa  233  8e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000174036 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08990  hypothetical protein  65.22 
 
 
142 aa  184  3e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.910252  normal  0.577713 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0626  hypothetical protein  44.37 
 
 
143 aa  150  8e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2942  hypothetical protein  32.88 
 
 
169 aa  103  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2655  hypothetical protein  46.24 
 
 
170 aa  94.7  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0831745  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0497  hypothetical protein  33.54 
 
 
164 aa  94  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000155339  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1533  hypothetical protein  37.41 
 
 
165 aa  91.3  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.475102  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3718  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  87  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431162 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3230  hypothetical protein  32.31 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0646  hypothetical protein  29.46 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  34.48 
 
 
823 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.33 
 
 
1080 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  35.42 
 
 
1081 aa  51.2  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  41.18 
 
 
406 aa  49.7  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0681  hypothetical protein  23.39 
 
 
125 aa  48.1  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1894  type II secretion system protein E  36.96 
 
 
317 aa  47.4  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  34.62 
 
 
806 aa  47  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0010  hypothetical protein  36.84 
 
 
1503 aa  47  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.969118  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2408  hypothetical protein  29.58 
 
 
178 aa  44.3  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  37.25 
 
 
376 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  36 
 
 
325 aa  43.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  31.91 
 
 
388 aa  43.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0508  hypothetical protein  32.5 
 
 
190 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0982  putative transcriptional regulator, CopG family  35.56 
 
 
246 aa  42.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.01357  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0167  hypothetical protein  36.73 
 
 
197 aa  42.4  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0574  hypothetical protein  27.63 
 
 
190 aa  42  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0435  hypothetical protein  38.78 
 
 
288 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  38.3 
 
 
1141 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1411  hypothetical protein  32.05 
 
 
190 aa  42  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2825  hypothetical protein  32.65 
 
 
204 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2374  hypothetical protein  31.08 
 
 
498 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2605  hypothetical protein  40.54 
 
 
543 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988047  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0525  hypothetical protein  28.3 
 
 
198 aa  40.8  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.497399  normal  0.602099 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0127  hypothetical protein  32.05 
 
 
113 aa  40.4  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.553071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>