16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0525 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0525  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  392  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.497399  normal  0.602099 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0167  hypothetical protein  51.21 
 
 		 197 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2408  hypothetical protein  52.79 
 
 		 178 aa  179  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0982  putative transcriptional regulator, CopG family  41.46 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.01357  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2825  hypothetical protein  47.42 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  40.38 
 
 		 351 aa  52  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  35.19 
 
 		 380 aa  49.7  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  40 
 
 		 1080 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  40 
 
 		 1089 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  40 
 
 		 1081 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0010  hypothetical protein  43.75 
 
 		 1503 aa  42.7  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.969118  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4022  protein serine/threonine phosphatase  40 
 
 		 642 aa  42.4  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  33.85 
 
 		 370 aa  42  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1894  type II secretion system protein E  36 
 
 		 317 aa  42  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  39.22 
 
 		 325 aa  41.6  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3305  hypothetical protein  34.85 
 
 		 123 aa  41.2  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>