32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3718 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3718  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  343  7e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431162 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3230  hypothetical protein  85.8 
 
 		 169 aa  304  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2942  hypothetical protein  66.23 
 
 		 169 aa  202  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0497  hypothetical protein  52.44 
 
 		 164 aa  194  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000155339  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1533  hypothetical protein  38.97 
 
 		 165 aa  96.7  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.475102  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0681  hypothetical protein  38.98 
 
 		 125 aa  92  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11760  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  87  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.032321 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2655  hypothetical protein  38.79 
 
 		 170 aa  84.7  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0831745  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0626  hypothetical protein  29.32 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1908  hypothetical protein  35.04 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000174036 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08990  hypothetical protein  36.26 
 
 		 142 aa  73.9  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.910252  normal  0.577713 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  38.46 
 
 		 823 aa  50.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0646  hypothetical protein  41.86 
 
 		 110 aa  48.5  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 806 aa  48.5  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0574  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  38.78 
 
 		 325 aa  45.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4862  methionyl-tRNA synthetase  29.47 
 
 		 544 aa  45.1  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0542  hypothetical protein  37.29 
 
 		 374 aa  44.7  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884235 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0067  methionyl-tRNA synthetase  29.47 
 
 		 544 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2748  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  35.21 
 
 		 1005 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0329  hypothetical protein  34 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1411  hypothetical protein  34 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2977  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  38.78 
 
 		 1011 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118712  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0508  hypothetical protein  34 
 
 		 190 aa  42.4  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2885  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  38.78 
 
 		 1011 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2791  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  38.78 
 
 		 1008 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0315  hypothetical protein  37.25 
 
 		 352 aa  42  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.392755 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0982  putative transcriptional regulator, CopG family  40 
 
 		 246 aa  42  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.01357  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2408  hypothetical protein  39.62 
 
 		 178 aa  41.6  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5192  methionyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 		 544 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5177  methionyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 		 544 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5183  methionyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 		 544 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>