27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08990 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_08990  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  292  1e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.910252  normal  0.577713 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11760  hypothetical protein  65.22 
 
 
157 aa  206  7e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.032321 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1908  hypothetical protein  70 
 
 
183 aa  199  9e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000174036 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0626  hypothetical protein  42.03 
 
 
143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0497  hypothetical protein  36.36 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000155339  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1533  hypothetical protein  38.3 
 
 
165 aa  90.5  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.475102  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2942  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  87.8  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3718  hypothetical protein  34.07 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431162 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2655  hypothetical protein  35.65 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0831745  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3230  hypothetical protein  31.85 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0681  hypothetical protein  31.15 
 
 
125 aa  61.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0646  hypothetical protein  30 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  38.64 
 
 
823 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1894  type II secretion system protein E  37.78 
 
 
317 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  37.78 
 
 
1080 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  40 
 
 
1081 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  31.37 
 
 
806 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  33.72 
 
 
758 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  31.96 
 
 
744 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  37.25 
 
 
388 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  35 
 
 
406 aa  43.9  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1411  hypothetical protein  32.35 
 
 
190 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0574  hypothetical protein  31.51 
 
 
190 aa  43.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0508  hypothetical protein  30.88 
 
 
190 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0329  hypothetical protein  30.88 
 
 
190 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2408  hypothetical protein  32.81 
 
 
178 aa  41.2  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.61 
 
 
1089 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>