18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0626 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0626  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  288  2e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11760  hypothetical protein  44.37 
 
 		 157 aa  150  7e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.032321 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1908  hypothetical protein  44.37 
 
 		 183 aa  133  8e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000174036 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08990  hypothetical protein  42.03 
 
 		 142 aa  130  6e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.910252  normal  0.577713 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1533  hypothetical protein  38.03 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.475102  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2655  hypothetical protein  36.67 
 
 		 170 aa  91.3  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0831745  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2942  hypothetical protein  31.47 
 
 		 169 aa  87.4  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3718  hypothetical protein  29.32 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431162 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0497  hypothetical protein  31.72 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000155339  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3230  hypothetical protein  28.57 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0681  hypothetical protein  30.4 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0646  hypothetical protein  25 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 823 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 806 aa  50.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  38 
 
 		 325 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1894  type II secretion system protein E  35.56 
 
 		 317 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2185  hypothetical protein  26.87 
 
 		 214 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2374  hypothetical protein  25 
 
 		 498 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>