22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1908 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1908  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  373  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000174036 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11760  hypothetical protein  71.97 
 
 
157 aa  251  5.000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.032321 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08990  hypothetical protein  70 
 
 
142 aa  195  3e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.910252  normal  0.577713 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0626  hypothetical protein  45 
 
 
143 aa  148  5e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2942  hypothetical protein  36.62 
 
 
169 aa  97.4  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0497  hypothetical protein  35.77 
 
 
164 aa  94.4  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000155339  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1533  hypothetical protein  37.14 
 
 
165 aa  88.2  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.475102  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2655  hypothetical protein  43.96 
 
 
170 aa  84.3  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0831745  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3718  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431162 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3230  hypothetical protein  33.08 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.73 
 
 
1080 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0681  hypothetical protein  29.75 
 
 
125 aa  51.2  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  40.91 
 
 
823 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  36 
 
 
1081 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0646  hypothetical protein  28.83 
 
 
110 aa  49.3  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  34.62 
 
 
806 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1894  type II secretion system protein E  36.96 
 
 
317 aa  47.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.63 
 
 
1089 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  33.78 
 
 
406 aa  43.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0010  hypothetical protein  36.84 
 
 
1503 aa  43.5  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.969118  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  40.43 
 
 
1141 aa  42  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1411  hypothetical protein  31.17 
 
 
190 aa  41.6  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>