161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4917 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4917  band 7 protein  100 
 
 
301 aa  606  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149772  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2032  band 7 protein  56.95 
 
 
303 aa  329  3e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1830  band 7 protein  60.53 
 
 
303 aa  328  6e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1185  membrane protease  38.21 
 
 
316 aa  166  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4200  band 7 protein  35.57 
 
 
268 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525075  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4360  band 7 protein  33.08 
 
 
307 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0253  band 7 protein  33.46 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4422  band 7 protein  32.31 
 
 
307 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1957  band 7 protein  32.37 
 
 
360 aa  132  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0790596  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2498  band 7 protein  30.65 
 
 
316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08236  hypothetical protein  30.49 
 
 
271 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3100  band 7 protein  28.99 
 
 
318 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2467  band 7 protein  28.2 
 
 
318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0849083 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3569  membrane protease subunit  27.76 
 
 
258 aa  116  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3709  hypothetical protein  30.45 
 
 
436 aa  115  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731081  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0362  band 7 protein  27.78 
 
 
321 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0303  SPFH domain-containing protein  29.82 
 
 
364 aa  90.5  3e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.496264  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1182  membrane protease  26.32 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1708  SPFH domain-containing protein  27.04 
 
 
362 aa  82.4  0.000000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1876  Band 7 protein  29.8 
 
 
372 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1730  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.54 
 
 
437 aa  79.3  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2728  hypothetical protein  27.56 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000677949 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0179  band 7 protein  26.24 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1448  SPFH domain-containing protein  30.29 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.125445  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1405  conserved hypothetical transmembrane protein (SPFH domain / Band 7 family)  27.42 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3604  band 7 protein  29.44 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10521 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0317  SPFH domain-containing protein  27.37 
 
 
362 aa  77  0.0000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.134016  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0295  SPFH domain-containing protein  27.37 
 
 
362 aa  77  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  29.51 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2987  band 7 protein  30.92 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1813  band 7 protein  24.81 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5029  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.41 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.290689  normal  0.430447 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2167  hypothetical protein  25.79 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.772353  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0854  cation-transporting ATPase, P-type  31.44 
 
 
364 aa  68.9  0.00000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41824  predicted protein  25 
 
 
282 aa  67.4  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.699109  normal  0.209561 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_54958  prohibitin-like protein  23.64 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00686  prohibitin complex subunit Phb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13470)  24.43 
 
 
280 aa  65.5  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2108  SPFH domain-containing protein  29.52 
 
 
370 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_54960  predicted protein  23.26 
 
 
269 aa  64.7  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0825  band 7 protein  26.18 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2852  band 7 protein  22.73 
 
 
284 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0145  putative transmembrane protein  22.65 
 
 
302 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.943019  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0038  band 7 protein  22.13 
 
 
302 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0728  band 7 protein  26.48 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49447  predicted protein  23.6 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0166572  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3545  band 7 protein  23.66 
 
 
291 aa  60.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.978436  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0044  band 7 protein  21.66 
 
 
302 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.179688 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1663  hypothetical protein  23.9 
 
 
341 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0672559  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0815  band 7 protein  25.19 
 
 
278 aa  59.7  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000157152  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0534  bacteriophage/transposase fusion protein  25.21 
 
 
399 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00780  prohibitin PHB1, putative  27.16 
 
 
274 aa  59.3  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1945  bacteriophage/transposase fusion protein  25.21 
 
 
462 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0496  band 7 protein  25.99 
 
 
282 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0512  band 7 protein  25.99 
 
 
282 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000338316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3018  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.42 
 
 
261 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.126407  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04831  Band 7 protein  26.92 
 
 
267 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.297877  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3288  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.91 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4401  band 7 protein  21.9 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3397  band 7 protein  24.55 
 
 
279 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4464  band 7 protein  21.9 
 
 
268 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0054233  normal  0.226289 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1017  bacteriophage/transposase fusion protein  23.08 
 
 
270 aa  57  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0310816  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7190  membrane protease  23.94 
 
 
367 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.996167  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2364  band 7 protein  25.09 
 
 
286 aa  56.2  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5210  band 7 protein  22.78 
 
 
311 aa  55.8  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1074  band 7 protein  24.45 
 
 
282 aa  55.8  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0083  Band 7 protein  25.26 
 
 
830 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.148744  hitchhiker  0.00195276 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76983  predicted protein  24.69 
 
 
302 aa  55.1  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0235  band 7 protein  24.77 
 
 
331 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.144192 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1029  band 7 protein  25.35 
 
 
340 aa  54.3  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00070  proteolysis and peptidolysis-related protein, putative  26.47 
 
 
318 aa  53.9  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0637663  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1873  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25 
 
 
280 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0154028  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06073  putative prohibitin (Eurofung)  22.13 
 
 
307 aa  53.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.453994  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  26.5 
 
 
292 aa  53.5  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  25.5 
 
 
336 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.91 
 
 
359 aa  53.5  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1845  band 7 protein  24.26 
 
 
280 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5109  band 7 protein  23.23 
 
 
326 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000505876  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2127  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.62 
 
 
286 aa  52.8  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.458205  normal  0.678014 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2451  band 7 protein  24.62 
 
 
286 aa  52.8  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0504  band 7 protein  26.03 
 
 
361 aa  52.8  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2578  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.76 
 
 
376 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0749  band 7 protein  23.96 
 
 
340 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.810157  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29372  predicted protein  19.69 
 
 
278 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3439  band 7 protein  28.12 
 
 
361 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717632  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3684  band 7 protein  23.67 
 
 
327 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5610  band 7 protein  23.64 
 
 
265 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.606547  normal  0.386273 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2811  band 7 protein  25 
 
 
276 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103679  hitchhiker  0.00246808 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  23.55 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  26.94 
 
 
293 aa  50.4  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  21.76 
 
 
312 aa  50.4  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  24.21 
 
 
283 aa  50.8  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  24.21 
 
 
283 aa  50.8  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2373  band 7 protein  24.46 
 
 
304 aa  49.7  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5185  band 7 protein  25.95 
 
 
277 aa  48.9  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.133466 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.44 
 
 
312 aa  48.9  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1156  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.64 
 
 
318 aa  48.5  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.149138  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61642  Stomatin-like protein 3  22.18 
 
 
340 aa  48.9  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  22.79 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2133  band 7 protein  24.19 
 
 
647 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  22.77 
 
 
297 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>