65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5610 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5610  band 7 protein  100 
 
 
265 aa  547  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.606547  normal  0.386273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5185  band 7 protein  42.63 
 
 
277 aa  221  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.133466 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1663  hypothetical protein  31.09 
 
 
341 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0672559  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0534  bacteriophage/transposase fusion protein  30.89 
 
 
399 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1945  bacteriophage/transposase fusion protein  30.89 
 
 
462 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1017  bacteriophage/transposase fusion protein  29.69 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0310816  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0051  hypothetical protein  30.92 
 
 
276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.10901e-82  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0145  putative transmembrane protein  27.88 
 
 
302 aa  99.4  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.943019  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0038  band 7 protein  28.31 
 
 
302 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0044  band 7 protein  28.31 
 
 
302 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.179688 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2852  band 7 protein  25.91 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1813  band 7 protein  28.29 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1182  membrane protease  24 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2987  band 7 protein  23.64 
 
 
315 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0815  band 7 protein  25 
 
 
278 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000157152  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3569  membrane protease subunit  21.55 
 
 
258 aa  62.4  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  23.26 
 
 
318 aa  62  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2467  band 7 protein  30.39 
 
 
318 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0849083 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3604  band 7 protein  22.9 
 
 
312 aa  59.7  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10521 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2167  hypothetical protein  23.18 
 
 
282 aa  58.5  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.772353  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2032  band 7 protein  26.1 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1830  band 7 protein  24.81 
 
 
303 aa  55.8  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4401  band 7 protein  25.1 
 
 
268 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4464  band 7 protein  25.1 
 
 
268 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0054233  normal  0.226289 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2089  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.56 
 
 
259 aa  53.9  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4917  band 7 protein  24.35 
 
 
301 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149772  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3100  band 7 protein  21.85 
 
 
318 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04831  Band 7 protein  24.15 
 
 
267 aa  52.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.297877  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4033  band 7 protein  24.79 
 
 
295 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3910  band 7 protein  24.79 
 
 
295 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1226  band 7 protein  25.65 
 
 
293 aa  50.4  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0423  band 7 protein  24.79 
 
 
295 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3837  band 7 protein  24.79 
 
 
295 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.712498 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2498  band 7 protein  25.34 
 
 
316 aa  50.4  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1062  band 7 protein  23.72 
 
 
299 aa  50.1  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0362  band 7 protein  25.97 
 
 
321 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3398  band 7 protein  23.97 
 
 
295 aa  49.3  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0253  band 7 protein  22.03 
 
 
310 aa  48.9  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0444  band 7 protein  23.77 
 
 
295 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3581  band 7 protein  23.55 
 
 
295 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0448  band 7 protein  23.55 
 
 
295 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0445  hflC protein, putative  22.56 
 
 
296 aa  48.9  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0436  Band 7 protein  23.32 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.155422  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3545  band 7 protein  23.56 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.978436  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3236  band 7 protein  21.11 
 
 
295 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1185  membrane protease  21.69 
 
 
316 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1957  band 7 protein  26.11 
 
 
360 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0790596  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3650  band 7 protein  22.7 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210038  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0235  band 7 protein  29.63 
 
 
331 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.144192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5029  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  21.83 
 
 
267 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.290689  normal  0.430447 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05391  Band 7 protein  23.65 
 
 
267 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1815  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.65 
 
 
267 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3042  band 7 protein  23.55 
 
 
295 aa  45.8  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0728  band 7 protein  28.36 
 
 
276 aa  45.8  0.0008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1029  band 7 protein  28.93 
 
 
340 aa  45.4  0.0009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3629  band 7 protein  21.63 
 
 
298 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00841169  hitchhiker  0.00129487 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0749  band 7 protein  28.3 
 
 
340 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.810157  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0524  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.17 
 
 
264 aa  43.5  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.675016 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4200  band 7 protein  22.04 
 
 
268 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525075  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0825  band 7 protein  23.48 
 
 
287 aa  42.7  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05091  Band 7 protein  24.14 
 
 
267 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05381  Band 7 protein  24.14 
 
 
267 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1572  SPFH/band 7 family protein  24.27 
 
 
295 aa  42.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.915425  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0483  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.14 
 
 
267 aa  42  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2811  band 7 protein  41.54 
 
 
276 aa  42  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103679  hitchhiker  0.00246808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>