More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0728 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0728  band 7 protein  100 
 
 
276 aa  548  1e-155  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1813  band 7 protein  36.23 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  29.46 
 
 
318 aa  133  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3604  band 7 protein  29.21 
 
 
312 aa  132  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2987  band 7 protein  28.46 
 
 
315 aa  128  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0815  band 7 protein  33.2 
 
 
278 aa  116  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000157152  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2852  band 7 protein  32.05 
 
 
284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4401  band 7 protein  33.2 
 
 
268 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4464  band 7 protein  32.82 
 
 
268 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0054233  normal  0.226289 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5029  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.8 
 
 
267 aa  112  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.290689  normal  0.430447 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2167  hypothetical protein  29.92 
 
 
282 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.772353  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04831  Band 7 protein  26.91 
 
 
267 aa  97.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.297877  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3018  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.32 
 
 
261 aa  92.8  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.126407  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05391  Band 7 protein  26.84 
 
 
267 aa  92.4  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1815  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.84 
 
 
267 aa  92.4  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0436  Band 7 protein  27.05 
 
 
249 aa  92  9e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.155422  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3236  band 7 protein  27.11 
 
 
295 aa  91.3  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0253  band 7 protein  31.42 
 
 
310 aa  90.9  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12321  Band 7 protein  26.81 
 
 
266 aa  89.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3545  band 7 protein  27.48 
 
 
291 aa  89.4  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.978436  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2089  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.19 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1873  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.68 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0154028  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3397  band 7 protein  28.79 
 
 
279 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0524  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.34 
 
 
264 aa  86.3  5e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.675016 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49447  predicted protein  27.18 
 
 
275 aa  85.5  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0166572  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3629  band 7 protein  25.93 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00841169  hitchhiker  0.00129487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0496  band 7 protein  27.13 
 
 
282 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0512  band 7 protein  27.13 
 
 
282 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000338316 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_54960  predicted protein  26.72 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3650  band 7 protein  26.46 
 
 
305 aa  82  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210038  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05381  Band 7 protein  24.29 
 
 
267 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05091  Band 7 protein  24.29 
 
 
267 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  23.66 
 
 
312 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06073  putative prohibitin (Eurofung)  26.67 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.453994  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12799  prohibitin-like protein  27.64 
 
 
244 aa  81.3  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.15456  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41824  predicted protein  25.66 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.699109  normal  0.209561 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_54958  prohibitin-like protein  27.15 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1572  SPFH/band 7 family protein  25.17 
 
 
295 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.915425  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0825  band 7 protein  26.4 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05461  Band 7 protein  22.86 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.178963  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2721  band 7 protein  25.17 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000149129  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2636  SPFH/band 7 family protein  25.17 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156489  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1810  Band 7 protein  24.36 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0483  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.21 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2811  band 7 protein  27.98 
 
 
276 aa  77  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103679  hitchhiker  0.00246808 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00686  prohibitin complex subunit Phb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13470)  25.79 
 
 
280 aa  75.1  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00780  prohibitin PHB1, putative  26.47 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  26.32 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29372  predicted protein  26.57 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76983  predicted protein  25.85 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0179  band 7 protein  27.99 
 
 
363 aa  72.4  0.000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00070  proteolysis and peptidolysis-related protein, putative  23.77 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0637663  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1062  band 7 protein  24.83 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3076  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.81 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4057  band 7 protein  23.85 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0666  HflC protein  29.6 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1845  band 7 protein  25.38 
 
 
280 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3398  band 7 protein  24.81 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  25.73 
 
 
283 aa  67  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3910  band 7 protein  25.45 
 
 
295 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4033  band 7 protein  25.45 
 
 
295 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3837  band 7 protein  25.45 
 
 
295 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.712498 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0423  band 7 protein  25.45 
 
 
295 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  25.73 
 
 
283 aa  67  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0445  hflC protein, putative  25.77 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0444  band 7 protein  25.52 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4917  band 7 protein  26.02 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149772  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0303  SPFH domain-containing protein  27.62 
 
 
364 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.496264  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2373  band 7 protein  24.3 
 
 
304 aa  63.5  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3100  band 7 protein  23.4 
 
 
318 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  28.49 
 
 
283 aa  63.2  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  25.84 
 
 
282 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  28.26 
 
 
282 aa  62.4  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0448  band 7 protein  24.71 
 
 
295 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3581  band 7 protein  24.71 
 
 
295 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0347  band 7 protein  25.13 
 
 
254 aa  62.4  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0665  HflK protein  27.31 
 
 
322 aa  62  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1489  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.39 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.648158  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0472  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  20.17 
 
 
249 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1635  Band 7 protein  26.26 
 
 
256 aa  61.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5653  band 7 protein  24.68 
 
 
257 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592895  normal  0.980998 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1017  bacteriophage/transposase fusion protein  24.63 
 
 
270 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0310816  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1081  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.68 
 
 
257 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348982  decreased coverage  0.00598719 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2498  band 7 protein  22.74 
 
 
316 aa  59.3  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  28.5 
 
 
286 aa  58.9  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5123  band 7 protein  24 
 
 
259 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.345813 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06060  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  22.53 
 
 
378 aa  58.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1448  SPFH domain-containing protein  24.81 
 
 
359 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.125445  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1708  SPFH domain-containing protein  24.91 
 
 
362 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1663  hypothetical protein  25 
 
 
341 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0672559  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1064  band 7 protein  23.62 
 
 
308 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3042  band 7 protein  21.9 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2105  band 7 protein  24.7 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.585176 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0822  SPFH domain-containing protein  22.71 
 
 
257 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2175  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.71 
 
 
257 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275738  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0915  SPFH domain-containing protein  22.71 
 
 
257 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323341  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1401  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.24 
 
 
293 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0069  band 7 protein  25.24 
 
 
293 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0768  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.21 
 
 
295 aa  56.6  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.441934 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1601  band 7 protein  24.75 
 
 
252 aa  56.2  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.829525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>