More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0069 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0069  band 7 protein  100 
 
 
293 aa  577  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1401  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  99.66 
 
 
293 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2809  band 7 protein  96.59 
 
 
293 aa  537  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.361864  normal  0.174393 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0613  band 7 protein  76.39 
 
 
295 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.953423  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0768  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  72.16 
 
 
295 aa  430  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.441934 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3992  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  72.56 
 
 
296 aa  417  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0057  band 7 protein  75.09 
 
 
295 aa  414  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373876  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  36.07 
 
 
304 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1446  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.23 
 
 
305 aa  173  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162555  normal  0.124024 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3437  band 7 protein  35.23 
 
 
283 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.462208  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  35.11 
 
 
344 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0260  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.07 
 
 
286 aa  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  35.46 
 
 
326 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0297  band 7 protein  34.04 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2704  band 7 protein  34.98 
 
 
332 aa  163  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2364  band 7 protein  33.96 
 
 
286 aa  163  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0324  band 7 protein  34.4 
 
 
284 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4834  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.1 
 
 
284 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.220458  normal  0.54169 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0321  band 7 protein  34.4 
 
 
284 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  33.57 
 
 
336 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4712  band 7 protein  33.1 
 
 
284 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4890  band 7 protein  33.1 
 
 
284 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3305  band 7 protein  35.36 
 
 
345 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366608  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4626  band 7 protein  32.74 
 
 
284 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.137042 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3607  band 7 protein  35.36 
 
 
346 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4267  band 7 protein  33.08 
 
 
329 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.21 
 
 
328 aa  156  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1620  band 7 protein  31.23 
 
 
284 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000904409  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  33.67 
 
 
305 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  33.67 
 
 
305 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  33.67 
 
 
305 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  33.67 
 
 
305 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  33.67 
 
 
305 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3110  band 7 protein  31.84 
 
 
282 aa  155  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00709216  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5109  band 7 protein  33.7 
 
 
326 aa  155  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000505876  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0462  band 7 protein  34.23 
 
 
304 aa  155  9e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0070  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.21 
 
 
328 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  33.11 
 
 
305 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  33.11 
 
 
305 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  33.11 
 
 
305 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.11 
 
 
305 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.57 
 
 
309 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  33.83 
 
 
331 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.11 
 
 
305 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  33.11 
 
 
305 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  33.11 
 
 
305 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  33.11 
 
 
305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.45 
 
 
304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1091  band 7 protein  30.12 
 
 
282 aa  152  4e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01652  inner membrane protein  35.36 
 
 
321 aa  152  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2127  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.65 
 
 
286 aa  152  5e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.458205  normal  0.678014 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2451  band 7 protein  34.65 
 
 
286 aa  152  5e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4303  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.63 
 
 
311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.77 
 
 
305 aa  152  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1880  band 7 protein  33.85 
 
 
334 aa  152  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126513  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.41 
 
 
312 aa  152  8e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  34.26 
 
 
319 aa  151  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0086  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.7 
 
 
281 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  32.78 
 
 
322 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2735  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.71 
 
 
319 aa  149  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4541  band 7 protein  32.71 
 
 
329 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  33.83 
 
 
304 aa  149  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0608  band 7 protein  35.79 
 
 
286 aa  149  6e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  32.71 
 
 
318 aa  149  6e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0138  band 7 protein  32.71 
 
 
318 aa  149  8e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0862  band 7 protein  32.21 
 
 
336 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3004  band 7 protein  33.21 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0280  integral membrane protein  34.88 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  30.16 
 
 
326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.62 
 
 
359 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0139  band 7 protein  33.8 
 
 
289 aa  146  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.889576  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  33.58 
 
 
304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0649  putative membrane protease subunit-like protein  34.3 
 
 
291 aa  146  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.384803  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1153  band 7 protein  33.46 
 
 
301 aa  146  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.294255  hitchhiker  0.000000366449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.32 
 
 
303 aa  145  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132668  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0038  hypothetical protein  32.08 
 
 
300 aa  144  1e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  33.9 
 
 
304 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004150  stomatin family protein  32.54 
 
 
305 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4419  band 7 protein  34.7 
 
 
319 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1268  hypothetical protein  34.2 
 
 
304 aa  143  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.169836 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3162  band 7 protein  34.2 
 
 
304 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  34.93 
 
 
306 aa  143  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3024  SPFH/band 7 family protein  34.2 
 
 
304 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  30.25 
 
 
332 aa  143  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  31.67 
 
 
403 aa  141  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3024  band 7 protein  33.71 
 
 
304 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3243  SPFH domain/Band 7 family protein  31.1 
 
 
322 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000635475  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2064  SPFH domain/Band 7 family protein  31.21 
 
 
322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101789  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.21 
 
 
322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1928  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.21 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  31.21 
 
 
322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  31.21 
 
 
322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1359  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.67 
 
 
334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0198882 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  31.21 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.21 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2174  SPFH domain/Band 7 family protein  31.21 
 
 
322 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1034  band 7 protein  32.86 
 
 
307 aa  140  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  31.27 
 
 
369 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0404  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.26 
 
 
322 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.188122 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.52 
 
 
316 aa  138  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>