More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2947 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  100 
 
 		 282 aa  569  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  69.45 
 
 		 283 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  65.6 
 
 		 284 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  59.14 
 
 		 282 aa  354  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  60.69 
 
 		 283 aa  353  2e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0264  HflC protein  57.25 
 
 		 282 aa  311  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  49.24 
 
 		 300 aa  272  5.000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0002  HflC protein  46.3 
 
 		 281 aa  249  4e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  46.72 
 
 		 283 aa  246  4e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  43.68 
 
 		 290 aa  245  4.9999999999999997e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  44.24 
 
 		 283 aa  239  5e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  44.24 
 
 		 283 aa  239  5e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  42.91 
 
 		 308 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  41.24 
 
 		 300 aa  236  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  41.82 
 
 		 318 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  42.7 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  39.34 
 
 		 290 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  42.2 
 
 		 292 aa  229  3e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  43.37 
 
 		 295 aa  229  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  42.53 
 
 		 311 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  39.71 
 
 		 311 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  42.15 
 
 		 298 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  39.93 
 
 		 300 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  42.42 
 
 		 312 aa  223  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  41.22 
 
 		 286 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  40.43 
 
 		 284 aa  224  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  44.89 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  37.89 
 
 		 289 aa  222  4e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  43.66 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  42.59 
 
 		 286 aa  219  5e-56  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  38.87 
 
 		 281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2263  HflC protein  37.25 
 
 		 310 aa  215  7e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00649366  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  41.84 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3523  HflC protein  35.39 
 
 		 313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  40.43 
 
 		 289 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  38.89 
 
 		 320 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  41.57 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  38.54 
 
 		 316 aa  210  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  42.91 
 
 		 298 aa  209  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  38.54 
 
 		 313 aa  209  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  40.28 
 
 		 297 aa  208  6e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  38.73 
 
 		 281 aa  208  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  40 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  39.44 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0832  hflC protein  38.29 
 
 		 290 aa  206  4e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.379816  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  36.79 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  38.95 
 
 		 325 aa  205  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  39.05 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  39.05 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0886  HflC protein  40.79 
 
 		 340 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.340526 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  41.05 
 
 		 293 aa  202  4e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  40.7 
 
 		 289 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  38.83 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  41.05 
 
 		 289 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3614  HflC protein  35.89 
 
 		 313 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0702  HflC protein  36.84 
 
 		 310 aa  201  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0356  HflC protein  40.44 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.534146  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2000  HflC protein  40.44 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  41.54 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3671  HflC protein  40.84 
 
 		 369 aa  200  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3679  HflC protein  35.54 
 
 		 313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  41.4 
 
 		 289 aa  199  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  38.64 
 
 		 295 aa  198  7e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  38.27 
 
 		 303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  39.16 
 
 		 291 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  39.71 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  42.21 
 
 		 294 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  41.9 
 
 		 289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  40.7 
 
 		 287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  41.9 
 
 		 289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  41.9 
 
 		 289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  38.43 
 
 		 297 aa  195  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  38.43 
 
 		 297 aa  195  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  39.16 
 
 		 297 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  37.72 
 
 		 297 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  39.16 
 
 		 297 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  39.16 
 
 		 297 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  39.16 
 
 		 297 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0638  HflC protein  41.81 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  37.19 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  37.98 
 
 		 298 aa  193  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2735  protein hflC  36.97 
 
 		 297 aa  192  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0491808  normal  0.0307139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  42.25 
 
 		 289 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  37.59 
 
 		 292 aa  192  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  35.69 
 
 		 292 aa  192  7e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3172  HflC protein  36.79 
 
 		 300 aa  191  8e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  36.93 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  35.56 
 
 		 300 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  38.38 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4126  HflC protein  37.55 
 
 		 320 aa  190  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3385  HflC protein  36.68 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  40.77 
 
 		 308 aa  189  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  38.95 
 
 		 297 aa  188  7e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0185  HflC protein  36.39 
 
 		 334 aa  188  8e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  37.1 
 
 		 292 aa  188  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  36.62 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  35.31 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  36.65 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  35.31 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  35.31 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>