More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3671 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3671  HflC protein  100 
 
 		 369 aa  716    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2000  HflC protein  71.72 
 
 		 340 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0356  HflC protein  61.64 
 
 		 340 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.534146  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0886  HflC protein  71.38 
 
 		 340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.340526 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  65.19 
 
 		 294 aa  355  5.999999999999999e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2735  protein hflC  62.93 
 
 		 297 aa  352  8e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0491808  normal  0.0307139 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3172  HflC protein  59.58 
 
 		 300 aa  320  3e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  46.99 
 
 		 311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  43.84 
 
 		 290 aa  239  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  43.71 
 
 		 318 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  43.31 
 
 		 311 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  43.31 
 
 		 300 aa  235  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  45.55 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  46.35 
 
 		 300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  44.09 
 
 		 308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  43.53 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  42.49 
 
 		 299 aa  228  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  43.49 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  42.91 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_004310  BR1396  hflC protein  43.4 
 
 		 300 aa  215  9e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685975  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1795  HflC protein  44.33 
 
 		 300 aa  215  9e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1352  HflC protein  43.4 
 
 		 300 aa  215  9e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  41.55 
 
 		 320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0702  HflC protein  45.15 
 
 		 310 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  44.21 
 
 		 293 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  41.37 
 
 		 316 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  40.67 
 
 		 313 aa  212  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  40.65 
 
 		 282 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  40 
 
 		 284 aa  207  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  44.53 
 
 		 295 aa  206  8e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  37.46 
 
 		 292 aa  204  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  39.65 
 
 		 289 aa  203  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  39.31 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  40.14 
 
 		 298 aa  200  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  35.61 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  37.73 
 
 		 300 aa  197  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  37.24 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2799  HflC protein  41.13 
 
 		 321 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.565333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2540  HflC protein  41.54 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713322  normal  0.756997 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  37.32 
 
 		 283 aa  194  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  37.32 
 
 		 283 aa  194  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2816  HFLC protein  39.78 
 
 		 305 aa  192  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.273715  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  36.96 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  38.26 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  40.48 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  37.59 
 
 		 286 aa  191  2e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  34.89 
 
 		 290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  40.81 
 
 		 281 aa  189  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  37.85 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  37.11 
 
 		 293 aa  188  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  38.19 
 
 		 293 aa  186  6e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  38.2 
 
 		 283 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2017  HflC protein  41.34 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  38.79 
 
 		 293 aa  182  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3385  HflC protein  36.24 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  37.31 
 
 		 304 aa  180  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0832  hflC protein  36.96 
 
 		 290 aa  179  7e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.379816  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  38.91 
 
 		 287 aa  179  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  34.71 
 
 		 295 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  36.27 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  37.5 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  38.43 
 
 		 289 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  34.15 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  37.68 
 
 		 284 aa  176  5e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  33.22 
 
 		 294 aa  175  9e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  38.08 
 
 		 289 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  37.31 
 
 		 283 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  33.1 
 
 		 281 aa  174  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  36.79 
 
 		 300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00091  serine protease  32.59 
 
 		 326 aa  172  9e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0578  FtsH protease regulator HflC  29.73 
 
 		 333 aa  172  9e-42  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  34.72 
 
 		 289 aa  172  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  32.99 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  36.81 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1748  HflC protein  42.54 
 
 		 328 aa  170  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.224393  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  35.97 
 
 		 282 aa  170  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  34.04 
 
 		 292 aa  169  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  38.49 
 
 		 289 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  32.18 
 
 		 297 aa  169  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  32.53 
 
 		 297 aa  169  9e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  32.53 
 
 		 297 aa  169  9e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  31.63 
 
 		 288 aa  169  9e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002262  HflC protein  32.48 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00114995  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  38.08 
 
 		 289 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  38.43 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  32.31 
 
 		 297 aa  168  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  38.43 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  33.92 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  33.09 
 
 		 295 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  34.72 
 
 		 289 aa  167  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  35.47 
 
 		 287 aa  167  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  33.1 
 
 		 297 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  33.1 
 
 		 297 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  33.1 
 
 		 297 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  36.43 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  33.1 
 
 		 297 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  32.86 
 
 		 292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2761  hflC protein  30.7 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0386111  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  29.97 
 
 		 331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  39.5 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>