More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3795 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  100 
 
 		 334 aa  671    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  100 
 
 		 334 aa  671    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  100 
 
 		 334 aa  671    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  89.55 
 
 		 335 aa  583  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  81.82 
 
 		 331 aa  541  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04042  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  81.74 
 
 		 334 aa  531  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.040502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3818  HflC protein  81.74 
 
 		 334 aa  531  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4733  FtsH protease regulator HflC  81.74 
 
 		 334 aa  531  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4706  FtsH protease regulator HflC  81.74 
 
 		 334 aa  531  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04004  hypothetical protein  81.74 
 
 		 334 aa  531  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4417  FtsH protease regulator HflC  81.74 
 
 		 334 aa  531  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0358  FtsH protease regulator HflC  81.74 
 
 		 334 aa  531  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  hitchhiker  0.00397927 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  80 
 
 		 331 aa  532  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5691  FtsH protease regulator HflC  81.74 
 
 		 334 aa  531  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3838  FtsH protease regulator HflC  81.74 
 
 		 334 aa  531  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4646  FtsH protease regulator HflC  81.74 
 
 		 334 aa  531  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175793 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4782  FtsH protease regulator HflC  81.44 
 
 		 334 aa  527  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  0.242 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4632  FtsH protease regulator HflC  81.44 
 
 		 334 aa  527  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4725  FtsH protease regulator HflC  81.44 
 
 		 334 aa  527  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4642  FtsH protease regulator HflC  81.44 
 
 		 334 aa  527  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4761  FtsH protease regulator HflC  81.44 
 
 		 334 aa  527  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0538  FtsH protease regulator HflC  80.06 
 
 		 331 aa  521  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255691  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0578  FtsH protease regulator HflC  76.97 
 
 		 333 aa  518  1e-146  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0495  FtsH protease regulator HflC  80.66 
 
 		 331 aa  512  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  54.88 
 
 		 295 aa  355  3.9999999999999996e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002262  HflC protein  51.47 
 
 		 326 aa  347  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00114995  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2761  hflC protein  48.68 
 
 		 326 aa  342  4e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0386111  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00091  serine protease  51.67 
 
 		 326 aa  342  5.999999999999999e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  53.56 
 
 		 292 aa  330  3e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  52.74 
 
 		 297 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  53.4 
 
 		 298 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  53.73 
 
 		 293 aa  325  7e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  49.24 
 
 		 294 aa  324  1e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  50.77 
 
 		 292 aa  322  8e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  51.22 
 
 		 297 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  50.77 
 
 		 292 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  52.13 
 
 		 297 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  52.13 
 
 		 297 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  52.13 
 
 		 297 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  52.13 
 
 		 297 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  52.13 
 
 		 297 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  52.13 
 
 		 297 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  52.56 
 
 		 292 aa  318  7e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  49.38 
 
 		 288 aa  318  9e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  51.25 
 
 		 292 aa  317  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  50.92 
 
 		 294 aa  316  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  50.62 
 
 		 297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  52.22 
 
 		 295 aa  312  6.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  51.44 
 
 		 308 aa  310  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0549  membrane protease subunit HflC  41.08 
 
 		 304 aa  241  9e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0525  membrane protease subunit HflC  41.08 
 
 		 304 aa  239  4e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  37.96 
 
 		 284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  40.85 
 
 		 297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  39.69 
 
 		 295 aa  232  8.000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  40.06 
 
 		 298 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  39.2 
 
 		 302 aa  222  8e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  40.06 
 
 		 293 aa  220  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  36.48 
 
 		 291 aa  217  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  38.72 
 
 		 291 aa  217  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  37.61 
 
 		 292 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  39.42 
 
 		 287 aa  215  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  40.18 
 
 		 289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  38.03 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  38.7 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  39.57 
 
 		 289 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  36.62 
 
 		 293 aa  210  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  40.92 
 
 		 289 aa  208  8e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  42.32 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  38.56 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  42.32 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  40.62 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  40.78 
 
 		 289 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  36.89 
 
 		 289 aa  205  7e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  41.69 
 
 		 289 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  36.36 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  39.03 
 
 		 289 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  35.19 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  38.44 
 
 		 283 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02635  HflC protein  37.69 
 
 		 282 aa  200  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1721  HflC protein  37.8 
 
 		 287 aa  200  3e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1786  integral membrane proteinase  37.39 
 
 		 287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  38.76 
 
 		 287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3015  HflC protein  36.42 
 
 		 287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.698845  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3172  HflC protein  38.41 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  36.16 
 
 		 290 aa  195  9e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  36.66 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0638  HflC protein  40.92 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  35.95 
 
 		 304 aa  193  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  37.74 
 
 		 312 aa  192  8e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  37.27 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  34.57 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  34.04 
 
 		 318 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2735  protein hflC  34.91 
 
 		 297 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0491808  normal  0.0307139 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  36.97 
 
 		 304 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  35.02 
 
 		 289 aa  190  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  36.28 
 
 		 294 aa  189  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2010  HflC protein  37.61 
 
 		 293 aa  189  7e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0721507  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  33.83 
 
 		 294 aa  188  9e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  36.72 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  36.25 
 
 		 282 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>