More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1663 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  100 
 
 		 300 aa  599  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  66.55 
 
 		 318 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  64.44 
 
 		 308 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  64.46 
 
 		 311 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  63.27 
 
 		 300 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  63.76 
 
 		 311 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  61.67 
 
 		 299 aa  372  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  61.74 
 
 		 298 aa  370  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  60.49 
 
 		 312 aa  340  1e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  60.36 
 
 		 290 aa  332  3e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  63.36 
 
 		 295 aa  332  6e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  54.61 
 
 		 328 aa  326  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  53.14 
 
 		 325 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  53.77 
 
 		 316 aa  316  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  53.77 
 
 		 313 aa  315  5e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  54.27 
 
 		 320 aa  311  9e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0702  HflC protein  55.81 
 
 		 310 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  55.09 
 
 		 293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  44.57 
 
 		 290 aa  267  2e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  48.25 
 
 		 300 aa  267  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  42.75 
 
 		 289 aa  263  3e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  46.13 
 
 		 281 aa  249  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  46.62 
 
 		 292 aa  247  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_002978  WD0832  hflC protein  44.91 
 
 		 290 aa  246  4e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.379816  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3385  HflC protein  43.46 
 
 		 306 aa  246  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  42.65 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  41.24 
 
 		 282 aa  236  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2735  protein hflC  46.15 
 
 		 297 aa  236  4e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0491808  normal  0.0307139 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  42.7 
 
 		 283 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  46.59 
 
 		 294 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1795  HflC protein  45.91 
 
 		 300 aa  234  9e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2816  HFLC protein  46.59 
 
 		 305 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.273715  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  40.36 
 
 		 286 aa  233  3e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1396  hflC protein  43.14 
 
 		 300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685975  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1352  HflC protein  43.14 
 
 		 300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2000  HflC protein  43.71 
 
 		 340 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0356  HflC protein  43.71 
 
 		 340 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.534146  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  42.69 
 
 		 283 aa  230  3e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3172  HflC protein  45.26 
 
 		 300 aa  228  8e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0886  HflC protein  44.72 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.340526 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3671  HflC protein  45.42 
 
 		 369 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  39.44 
 
 		 293 aa  219  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2017  HflC protein  45.45 
 
 		 310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  40.16 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  40.16 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  39.22 
 
 		 289 aa  218  7e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  41.11 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  38.43 
 
 		 295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  38.57 
 
 		 284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  40.93 
 
 		 302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  38.37 
 
 		 283 aa  215  7e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  40.43 
 
 		 293 aa  210  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  39.79 
 
 		 298 aa  211  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  38.21 
 
 		 297 aa  209  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  36.23 
 
 		 331 aa  209  5e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  38.97 
 
 		 292 aa  208  8e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  36.23 
 
 		 331 aa  208  9e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0264  HflC protein  38.99 
 
 		 282 aa  206  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2540  HflC protein  41.22 
 
 		 319 aa  205  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713322  normal  0.756997 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  36.97 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2799  HflC protein  41.38 
 
 		 321 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.565333 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  39.31 
 
 		 294 aa  202  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1748  HflC protein  47.97 
 
 		 328 aa  202  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.224393  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  40.42 
 
 		 289 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  40.77 
 
 		 289 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  39.85 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3332  band 7 protein  42.61 
 
 		 283 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.453043  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  36.57 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  37.28 
 
 		 292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  35.54 
 
 		 292 aa  199  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0538  FtsH protease regulator HflC  36.78 
 
 		 331 aa  199  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255691  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  36.86 
 
 		 300 aa  199  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  37.23 
 
 		 304 aa  198  7.999999999999999e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  36.43 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  40.29 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  34.95 
 
 		 292 aa  196  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  39.93 
 
 		 289 aa  195  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  36.4 
 
 		 295 aa  193  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  35.54 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  36.68 
 
 		 298 aa  193  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2248  band 7 protein  38.54 
 
 		 283 aa  193  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  36.43 
 
 		 297 aa  192  6e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  36.43 
 
 		 297 aa  192  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  35.87 
 
 		 335 aa  192  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  37.59 
 
 		 293 aa  192  8e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  36.23 
 
 		 281 aa  191  9e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  34.78 
 
 		 304 aa  191  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  36.62 
 
 		 295 aa  191  9e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  35.37 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  35.37 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  35.37 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  36.69 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  37.11 
 
 		 297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  36.43 
 
 		 297 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  37.11 
 
 		 297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  37.11 
 
 		 297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  37.11 
 
 		 297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3818  HflC protein  34.38 
 
 		 334 aa  189  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5691  FtsH protease regulator HflC  34.38 
 
 		 334 aa  189  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  33.91 
 
 		 295 aa  189  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>