More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2098 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  100 
 
 		 300 aa  605  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  93.33 
 
 		 303 aa  545  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  71.62 
 
 		 304 aa  454  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  73.83 
 
 		 304 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  74.16 
 
 		 304 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  58.98 
 
 		 295 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  61.62 
 
 		 289 aa  371  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  61.27 
 
 		 289 aa  364  1e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  57.53 
 
 		 296 aa  351  7e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  58.62 
 
 		 293 aa  341  8e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  56.64 
 
 		 295 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  58.27 
 
 		 292 aa  334  1e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2299  HflC protein  53.33 
 
 		 299 aa  333  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783703  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1178  HflC protein  53.18 
 
 		 301 aa  329  3e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1098  HflC protein  53.51 
 
 		 301 aa  322  6e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0072  HflC protein  51.97 
 
 		 302 aa  318  9e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.055112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  53.58 
 
 		 293 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2195  HflC protein  54.87 
 
 		 301 aa  311  6.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2600  HflC protein  53.69 
 
 		 300 aa  310  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.558304  normal  0.617958 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1880  HflC protein  54.89 
 
 		 299 aa  309  4e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5011  HflC protein  52.38 
 
 		 296 aa  305  8.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1432  HflC protein  53.07 
 
 		 299 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200171  normal  0.890554 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  53.82 
 
 		 294 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  51.29 
 
 		 284 aa  275  8e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  48.8 
 
 		 298 aa  264  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  44.97 
 
 		 302 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  44.95 
 
 		 289 aa  248  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  43.34 
 
 		 292 aa  248  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  43.05 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  43.14 
 
 		 297 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  42.81 
 
 		 294 aa  242  5e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  45.55 
 
 		 292 aa  242  6e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  43.64 
 
 		 294 aa  241  9e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1828  HflC protein  43.1 
 
 		 300 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540549  normal  0.180131 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  43.23 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  43.23 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  43.34 
 
 		 298 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6275  HflC protein  43.1 
 
 		 299 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364844  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1804  HflC protein  43.1 
 
 		 299 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266909  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1742  HflC protein  42.76 
 
 		 299 aa  238  8e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  41.69 
 
 		 292 aa  238  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1715  HflC protein  42.76 
 
 		 299 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  41.98 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5105  membrane protein, HflC  42.41 
 
 		 299 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  42.24 
 
 		 297 aa  236  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  42.9 
 
 		 297 aa  235  7e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  42.9 
 
 		 297 aa  235  7e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  42.9 
 
 		 297 aa  235  7e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  42.9 
 
 		 297 aa  235  7e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  46.42 
 
 		 293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1602  FtsH protease activity modulator HflC  44.85 
 
 		 300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155202  normal  0.359083 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1412  band 7 protein  45.2 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.0000177218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  44.33 
 
 		 289 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  42.65 
 
 		 292 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  43.97 
 
 		 289 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  41.1 
 
 		 288 aa  231  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1471  band 7 protein  42.28 
 
 		 299 aa  229  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0967739  normal  0.234957 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  45.08 
 
 		 287 aa  229  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2533  band 7 protein  43.97 
 
 		 300 aa  228  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00510027  hitchhiker  0.0000246325 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  42.12 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  42.47 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  42.36 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  42.91 
 
 		 297 aa  225  7e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  43.98 
 
 		 289 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  40.21 
 
 		 294 aa  222  4.9999999999999996e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  41.11 
 
 		 297 aa  221  9e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  39.15 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  39.37 
 
 		 295 aa  220  3e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  43.75 
 
 		 287 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  42.76 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  39.52 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  43.18 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  43.97 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  42.71 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  43.97 
 
 		 289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2242  HflC protein  42.76 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.564384  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  43.31 
 
 		 289 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  43.31 
 
 		 289 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  42.96 
 
 		 289 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2219  HflC protein  43.6 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1337  ftsH protease activity modulator HflC  43.6 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127713  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2181  HflC protein  43.6 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2346  HflC protein  43.6 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0070  ftsH protease activity modulator HflC  43.6 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216158  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1826  ftsH protease activity modulator HflC  43.6 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  35.54 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0638  HflC protein  43.62 
 
 		 289 aa  208  7e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  35.44 
 
 		 331 aa  207  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  35.14 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  34.93 
 
 		 289 aa  206  3e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0358  FtsH protease regulator HflC  37.03 
 
 		 334 aa  206  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  hitchhiker  0.00397927 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  40.35 
 
 		 281 aa  206  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  36.17 
 
 		 335 aa  205  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  35.45 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  35.45 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  40.64 
 
 		 284 aa  203  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  35.45 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0578  FtsH protease regulator HflC  33.63 
 
 		 333 aa  203  3e-51  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4417  FtsH protease regulator HflC  36.71 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5691  FtsH protease regulator HflC  36.71 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>