More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0900 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  100 
 
 		 289 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  77.61 
 
 		 294 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  52.08 
 
 		 293 aa  300  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  53.14 
 
 		 302 aa  298  7e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  50.36 
 
 		 295 aa  295  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  52.19 
 
 		 292 aa  291  6e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  53.67 
 
 		 294 aa  291  6e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  49.09 
 
 		 284 aa  285  7e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  51.54 
 
 		 298 aa  285  7e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  54.65 
 
 		 287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  50.37 
 
 		 304 aa  282  5.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  50.17 
 
 		 293 aa  278  9e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  52.47 
 
 		 287 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  45.94 
 
 		 293 aa  265  8e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  50.18 
 
 		 289 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  49.47 
 
 		 289 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  50.36 
 
 		 291 aa  263  3e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  44.41 
 
 		 291 aa  258  7e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  47.67 
 
 		 293 aa  258  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  50.57 
 
 		 289 aa  256  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  43.25 
 
 		 294 aa  255  6e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  45.45 
 
 		 304 aa  253  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  50.72 
 
 		 289 aa  252  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  45.99 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  50.36 
 
 		 289 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  46.32 
 
 		 292 aa  250  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  43.21 
 
 		 290 aa  249  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  44.95 
 
 		 300 aa  248  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  43.3 
 
 		 298 aa  247  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  43.3 
 
 		 292 aa  246  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  46.1 
 
 		 295 aa  245  4.9999999999999997e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  45.66 
 
 		 304 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  45.66 
 
 		 304 aa  245  6e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  43.68 
 
 		 289 aa  244  9e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  43.9 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0638  HflC protein  51.97 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  42.05 
 
 		 288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  43 
 
 		 297 aa  243  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  47.53 
 
 		 289 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  44.03 
 
 		 297 aa  242  5e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  44.03 
 
 		 297 aa  242  5e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  45.09 
 
 		 303 aa  241  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  48.2 
 
 		 289 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  42.96 
 
 		 289 aa  240  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  47.67 
 
 		 289 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  47.67 
 
 		 289 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  45.79 
 
 		 292 aa  239  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  41.55 
 
 		 297 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  41.55 
 
 		 297 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  41.55 
 
 		 297 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  41.55 
 
 		 297 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  41.87 
 
 		 292 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02635  HflC protein  44.84 
 
 		 282 aa  236  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  42.71 
 
 		 295 aa  236  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  44.79 
 
 		 300 aa  236  5.0000000000000005e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  42.62 
 
 		 297 aa  235  6e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  42.55 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2010  HflC protein  46.76 
 
 		 293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0721507  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  41.16 
 
 		 295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  42.91 
 
 		 308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  42.46 
 
 		 318 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3015  HflC protein  42.6 
 
 		 287 aa  229  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.698845  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  42.76 
 
 		 325 aa  228  7e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  43.27 
 
 		 299 aa  228  7e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  42.71 
 
 		 308 aa  227  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  41.4 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  40.69 
 
 		 294 aa  224  9e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  41.58 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  44.15 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1786  integral membrane proteinase  42.81 
 
 		 287 aa  223  2e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1721  HflC protein  42.81 
 
 		 287 aa  223  3e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  43.21 
 
 		 293 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  40.99 
 
 		 311 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00091  serine protease  39.63 
 
 		 326 aa  221  9e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  39.37 
 
 		 320 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0525  membrane protease subunit HflC  40.52 
 
 		 304 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0549  membrane protease subunit HflC  40.15 
 
 		 304 aa  218  7.999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  41.82 
 
 		 298 aa  217  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2761  hflC protein  40.31 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0386111  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  39.64 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  40.14 
 
 		 316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  40.21 
 
 		 294 aa  215  5e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  40.14 
 
 		 313 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002262  HflC protein  38.7 
 
 		 326 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00114995  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  39.45 
 
 		 328 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  42.14 
 
 		 284 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  41.57 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  39.35 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5011  HflC protein  41.04 
 
 		 296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  42.37 
 
 		 292 aa  212  5.999999999999999e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  40.43 
 
 		 282 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2600  HflC protein  39.07 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.558304  normal  0.617958 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04004  hypothetical protein  38.8 
 
 		 334 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4706  FtsH protease regulator HflC  38.8 
 
 		 334 aa  210  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3838  FtsH protease regulator HflC  38.8 
 
 		 334 aa  210  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1432  HflC protein  40.66 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200171  normal  0.890554 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4646  FtsH protease regulator HflC  38.8 
 
 		 334 aa  210  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5691  FtsH protease regulator HflC  38.8 
 
 		 334 aa  210  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1178  HflC protein  38.59 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4417  FtsH protease regulator HflC  38.8 
 
 		 334 aa  210  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>