More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2280 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  100 
 
 		 283 aa  577  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  75.99 
 
 		 284 aa  444  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  69.45 
 
 		 282 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  69.85 
 
 		 282 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  60.38 
 
 		 283 aa  343  2e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0264  HflC protein  60.07 
 
 		 282 aa  308  5e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  49.61 
 
 		 300 aa  268  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  44 
 
 		 318 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  42.75 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  41.82 
 
 		 300 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  42.7 
 
 		 300 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0002  HflC protein  43.19 
 
 		 281 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  43.73 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  43.27 
 
 		 290 aa  230  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  41.82 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  41.18 
 
 		 283 aa  228  7e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  41.18 
 
 		 283 aa  228  7e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  43.77 
 
 		 283 aa  228  8e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  39.27 
 
 		 290 aa  226  3e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  42.42 
 
 		 299 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  43.63 
 
 		 298 aa  225  6e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  41.61 
 
 		 292 aa  224  9e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  38.43 
 
 		 286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  39.35 
 
 		 286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  40.35 
 
 		 295 aa  218  6e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  36.69 
 
 		 289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  41.98 
 
 		 312 aa  215  7e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  42.29 
 
 		 293 aa  211  9e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  40.14 
 
 		 316 aa  211  9e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  42.45 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  41.01 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0832  hflC protein  41.13 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.379816  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  39.93 
 
 		 297 aa  208  7e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  40.29 
 
 		 302 aa  207  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  41.09 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  41.05 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  37.23 
 
 		 290 aa  205  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  37.23 
 
 		 290 aa  205  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  41.09 
 
 		 289 aa  205  9e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  39.5 
 
 		 320 aa  204  9e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  38.81 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  36.92 
 
 		 281 aa  202  5e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  37.99 
 
 		 284 aa  202  7e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3385  HflC protein  38.89 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  38.44 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  38.44 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  38.75 
 
 		 328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  42.64 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  38.93 
 
 		 295 aa  200  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  43.68 
 
 		 294 aa  199  5e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  38.1 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  37.72 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3172  HflC protein  38.93 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  37.29 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0702  HflC protein  39.45 
 
 		 310 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  37.72 
 
 		 303 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  35.82 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  41.49 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2263  HflC protein  35.91 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00649366  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  38.65 
 
 		 291 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  40.43 
 
 		 287 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  38.3 
 
 		 294 aa  193  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  41.49 
 
 		 289 aa  192  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  38.31 
 
 		 297 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  38.31 
 
 		 297 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  38.31 
 
 		 297 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  36.27 
 
 		 298 aa  192  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  38.31 
 
 		 297 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  39.62 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  38.95 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  38.22 
 
 		 287 aa  189  5e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  41.84 
 
 		 289 aa  188  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  36.11 
 
 		 292 aa  188  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  39.07 
 
 		 298 aa  187  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  41.49 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  35.94 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  41.49 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3523  HflC protein  33.77 
 
 		 313 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  35.76 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  41.13 
 
 		 289 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  37.32 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  40.79 
 
 		 293 aa  185  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0638  HflC protein  42.81 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  36.17 
 
 		 288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0886  HflC protein  37.76 
 
 		 340 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.340526 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  41.13 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  37.96 
 
 		 289 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  35.93 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  36.3 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0356  HflC protein  37.06 
 
 		 340 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.534146  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  33.85 
 
 		 335 aa  179  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2000  HflC protein  37.06 
 
 		 340 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2010  HflC protein  40.86 
 
 		 293 aa  179  4.999999999999999e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0721507  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  35.93 
 
 		 295 aa  179  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  42.03 
 
 		 289 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  34.86 
 
 		 294 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  42.03 
 
 		 289 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4126  HflC protein  36.57 
 
 		 320 aa  178  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  36.33 
 
 		 296 aa  178  9e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  34.36 
 
 		 334 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>