More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4126 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4126  HflC protein  100 
 
 		 320 aa  642    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  38.89 
 
 		 283 aa  204  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  40.84 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  37.19 
 
 		 282 aa  193  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  34.75 
 
 		 281 aa  185  1.0000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  33.92 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2263  HflC protein  35.5 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00649366  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  35.94 
 
 		 283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  36.52 
 
 		 284 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  34.63 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  33.92 
 
 		 290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  33.92 
 
 		 290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  34.46 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  35.36 
 
 		 282 aa  169  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  34.83 
 
 		 293 aa  167  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  32.51 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  32.42 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  32.42 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0264  HflC protein  35.07 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  30.74 
 
 		 300 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0002  HflC protein  34.35 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  35.19 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  32.21 
 
 		 308 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  32.65 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  32.51 
 
 		 300 aa  161  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  35.93 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  32.27 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  32.45 
 
 		 283 aa  159  5e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3523  HflC protein  32.68 
 
 		 313 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  33.95 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  33.46 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  33.09 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  29.93 
 
 		 289 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  30.96 
 
 		 304 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3614  HflC protein  32.87 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3679  HflC protein  32.63 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  30.39 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0314  hflC protein, putative  33.91 
 
 		 320 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  37.32 
 
 		 293 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  29.82 
 
 		 289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  32.89 
 
 		 292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  30.9 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  33.67 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  33.1 
 
 		 286 aa  151  2e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  36.03 
 
 		 287 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  32.41 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0666  HflC protein  31.58 
 
 		 289 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  32.74 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  31.97 
 
 		 289 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  30.5 
 
 		 290 aa  149  4e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  32.19 
 
 		 284 aa  150  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  32.09 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1178  HflC protein  31.23 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1098  HflC protein  31.23 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2735  protein hflC  32.44 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0491808  normal  0.0307139 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  34.4 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2797  HflC protein  32.18 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  30.72 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  31.14 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  36.53 
 
 		 289 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  31.47 
 
 		 281 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0185  HflC protein  34.24 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  35.79 
 
 		 289 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  31.6 
 
 		 328 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3172  HflC protein  33.21 
 
 		 300 aa  145  9e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  31.74 
 
 		 294 aa  145  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  32.22 
 
 		 288 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  31.14 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  35.42 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  31.97 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00091  serine protease  30.7 
 
 		 326 aa  143  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3671  HflC protein  32.64 
 
 		 369 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150506  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0832  hflC protein  31.11 
 
 		 290 aa  143  4e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.379816  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  29.86 
 
 		 304 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  29.86 
 
 		 296 aa  143  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  32.2 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1432  HflC protein  30.45 
 
 		 299 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200171  normal  0.890554 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2600  HflC protein  29.74 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.558304  normal  0.617958 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  32.72 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0578  FtsH protease regulator HflC  30.22 
 
 		 333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0072  HflC protein  28.87 
 
 		 302 aa  139  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.055112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  32.12 
 
 		 293 aa  139  7.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2299  HflC protein  29.76 
 
 		 299 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783703  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  30.15 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  29.68 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2761  hflC protein  29.77 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0386111  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002262  HflC protein  29.14 
 
 		 326 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00114995  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2195  HflC protein  31.23 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  35.06 
 
 		 289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  29.47 
 
 		 334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  29.47 
 
 		 334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  29.47 
 
 		 334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  29.14 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0356  HflC protein  31.6 
 
 		 340 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.534146  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2000  HflC protein  31.6 
 
 		 340 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  28.91 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  33.46 
 
 		 287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5011  HflC protein  32.59 
 
 		 296 aa  135  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  30.55 
 
 		 292 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0886  HflC protein  31.97 
 
 		 340 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.340526 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>