More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0666 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0666  HflC protein  100 
 
 		 289 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3821  band 7 protein  45.1 
 
 		 301 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.153561  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  40.65 
 
 		 281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  38.26 
 
 		 283 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  38.26 
 
 		 283 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  36.65 
 
 		 286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  38.17 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  36.36 
 
 		 283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  29.72 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  34.24 
 
 		 300 aa  176  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  32.03 
 
 		 283 aa  175  8e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  34.36 
 
 		 282 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  33.33 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  31.36 
 
 		 284 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  29.79 
 
 		 318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  28.77 
 
 		 325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  30.88 
 
 		 313 aa  166  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  30.88 
 
 		 316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  29.43 
 
 		 300 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  30 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  29.79 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  30.26 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  29.07 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0002  HflC protein  36.65 
 
 		 281 aa  160  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  26.3 
 
 		 328 aa  156  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  29.04 
 
 		 299 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0702  HflC protein  28.73 
 
 		 310 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  34.59 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  31.65 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0264  HflC protein  33.94 
 
 		 282 aa  152  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  30.42 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  29.52 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  29.76 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4126  HflC protein  31.58 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  28.57 
 
 		 290 aa  148  9e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  29.45 
 
 		 294 aa  145  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2263  HflC protein  29.55 
 
 		 310 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00649366  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  30.58 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  26.95 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  32 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  29.58 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  26.95 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  26.95 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  29.86 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  32.53 
 
 		 292 aa  143  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  29.59 
 
 		 295 aa  142  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  30.07 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  30.14 
 
 		 295 aa  142  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  27.38 
 
 		 331 aa  142  8e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  29.79 
 
 		 284 aa  142  9e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  29.89 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  27.3 
 
 		 335 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  28.78 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  32.18 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  29.76 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  27.33 
 
 		 331 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0923  putative HflC protein  31.63 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  28.78 
 
 		 289 aa  139  4.999999999999999e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  30.5 
 
 		 292 aa  139  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0832  hflC protein  32.05 
 
 		 290 aa  138  8.999999999999999e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.379816  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  30.03 
 
 		 292 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  26.99 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  30.38 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0525  membrane protease subunit HflC  30.8 
 
 		 304 aa  136  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3172  HflC protein  29.08 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  30.24 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  28.62 
 
 		 291 aa  136  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3523  HflC protein  27.42 
 
 		 313 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  27.99 
 
 		 312 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0538  FtsH protease regulator HflC  25.78 
 
 		 331 aa  135  9e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255691  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4632  FtsH protease regulator HflC  28.03 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4642  FtsH protease regulator HflC  28.03 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  31.77 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2010  HflC protein  30.28 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0721507  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4782  FtsH protease regulator HflC  28.03 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  0.242 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4725  FtsH protease regulator HflC  28.03 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  31.77 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  31.77 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  29.97 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4761  FtsH protease regulator HflC  28.03 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  31.77 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04042  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  27.56 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.040502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3818  HflC protein  27.56 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4417  FtsH protease regulator HflC  27.56 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5691  FtsH protease regulator HflC  27.56 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4646  FtsH protease regulator HflC  27.56 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175793 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  29.76 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3838  FtsH protease regulator HflC  27.56 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04004  hypothetical protein  27.56 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4706  FtsH protease regulator HflC  27.56 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4733  FtsH protease regulator HflC  27.56 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3614  HflC protein  28.97 
 
 		 313 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  30.94 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  31.23 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3385  HflC protein  29.3 
 
 		 306 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0549  membrane protease subunit HflC  30.77 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0546  HflC protein  28.84 
 
 		 329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000495565  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  29.87 
 
 		 295 aa  132  5e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  30.3 
 
 		 297 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  30.3 
 
 		 297 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>