More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0444 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  100 
 
 		 292 aa  592  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  70.07 
 
 		 295 aa  421  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  68.75 
 
 		 293 aa  412  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  72.18 
 
 		 294 aa  412  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  70.07 
 
 		 293 aa  410  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  57.54 
 
 		 304 aa  340  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  59.49 
 
 		 303 aa  334  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  58.27 
 
 		 300 aa  334  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  58.03 
 
 		 289 aa  332  4e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  59.12 
 
 		 289 aa  332  6e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  56.89 
 
 		 304 aa  322  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  56.54 
 
 		 304 aa  321  9.000000000000001e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  53.43 
 
 		 284 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  53.71 
 
 		 298 aa  302  4.0000000000000003e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  49.13 
 
 		 295 aa  295  5e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  52.99 
 
 		 304 aa  292  5e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  52.19 
 
 		 289 aa  291  6e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  48.24 
 
 		 302 aa  289  5.0000000000000004e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  49.13 
 
 		 296 aa  288  7e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  51.58 
 
 		 289 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  51.04 
 
 		 289 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2299  HflC protein  48.11 
 
 		 299 aa  279  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783703  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1178  HflC protein  51.59 
 
 		 301 aa  280  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  51.49 
 
 		 287 aa  279  5e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  47.62 
 
 		 293 aa  278  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  53.36 
 
 		 287 aa  276  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1098  HflC protein  52.01 
 
 		 301 aa  276  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2600  HflC protein  50.36 
 
 		 300 aa  276  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.558304  normal  0.617958 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  48.96 
 
 		 293 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5011  HflC protein  48.47 
 
 		 296 aa  271  9e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  49.44 
 
 		 294 aa  270  2e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0072  HflC protein  51.08 
 
 		 302 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.055112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  50 
 
 		 289 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1880  HflC protein  50 
 
 		 299 aa  269  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  48.28 
 
 		 291 aa  268  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  48.12 
 
 		 298 aa  266  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1432  HflC protein  50.37 
 
 		 299 aa  266  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200171  normal  0.890554 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2195  HflC protein  50.56 
 
 		 301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  46.26 
 
 		 291 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  51.12 
 
 		 289 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  48.11 
 
 		 297 aa  265  7e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  48.11 
 
 		 297 aa  265  7e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  48.97 
 
 		 297 aa  265  8e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  46.42 
 
 		 292 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  47.42 
 
 		 297 aa  264  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  47.78 
 
 		 292 aa  263  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  46.94 
 
 		 294 aa  262  6e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  49.65 
 
 		 289 aa  261  8e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  49.65 
 
 		 289 aa  261  8e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  48.97 
 
 		 289 aa  261  8e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0638  HflC protein  50.35 
 
 		 289 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  48.62 
 
 		 289 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  50 
 
 		 292 aa  260  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  48.91 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  45.73 
 
 		 292 aa  259  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  49.65 
 
 		 289 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  45.99 
 
 		 292 aa  259  3e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  46.05 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  46.05 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  46.05 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  42.71 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  46.05 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  44.76 
 
 		 288 aa  253  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  45.14 
 
 		 295 aa  249  3e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0549  membrane protease subunit HflC  44.16 
 
 		 304 aa  249  4e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  48.51 
 
 		 297 aa  248  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0525  membrane protease subunit HflC  44.16 
 
 		 304 aa  246  4e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  45.55 
 
 		 308 aa  241  7e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  43.21 
 
 		 290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  43.21 
 
 		 290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2010  HflC protein  46.26 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0721507  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  43.57 
 
 		 290 aa  237  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  43.87 
 
 		 300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  39.59 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002262  HflC protein  40.06 
 
 		 326 aa  230  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00114995  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  44.68 
 
 		 284 aa  229  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1721  HflC protein  41.32 
 
 		 287 aa  227  1e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00091  serine protease  39.31 
 
 		 326 aa  226  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2761  hflC protein  38.68 
 
 		 326 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0386111  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1786  integral membrane proteinase  40.97 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  41.94 
 
 		 318 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02635  HflC protein  38.79 
 
 		 282 aa  223  4e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  37.37 
 
 		 289 aa  222  6e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  43.66 
 
 		 282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3015  HflC protein  39.44 
 
 		 287 aa  219  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.698845  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1828  HflC protein  42.61 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540549  normal  0.180131 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1715  HflC protein  42.61 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6275  HflC protein  42.61 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364844  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1804  HflC protein  42.61 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266909  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  39.18 
 
 		 294 aa  216  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1742  HflC protein  42.25 
 
 		 299 aa  215  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  40.43 
 
 		 311 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  41.99 
 
 		 293 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  43.28 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  40.22 
 
 		 308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  36.42 
 
 		 334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  36.42 
 
 		 334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  36.42 
 
 		 334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  36.62 
 
 		 290 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  37.05 
 
 		 335 aa  212  4.9999999999999996e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>