More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1828 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1828  HflC protein  100 
 
 		 300 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540549  normal  0.180131 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1804  HflC protein  98 
 
 		 299 aa  547  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266909  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6275  HflC protein  98 
 
 		 299 aa  547  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364844  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5105  membrane protein, HflC  94.33 
 
 		 299 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1715  HflC protein  91.67 
 
 		 299 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1742  HflC protein  91.67 
 
 		 299 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1471  band 7 protein  88.33 
 
 		 299 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0967739  normal  0.234957 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2242  HflC protein  71.53 
 
 		 299 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.564384  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1337  ftsH protease activity modulator HflC  71.53 
 
 		 299 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127713  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2346  HflC protein  71.53 
 
 		 299 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1826  ftsH protease activity modulator HflC  71.53 
 
 		 299 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2181  HflC protein  71.53 
 
 		 299 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2219  HflC protein  71.53 
 
 		 299 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0070  ftsH protease activity modulator HflC  71.53 
 
 		 299 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216158  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1602  FtsH protease activity modulator HflC  61.67 
 
 		 300 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155202  normal  0.359083 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2533  band 7 protein  59.87 
 
 		 300 aa  295  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00510027  hitchhiker  0.0000246325 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1412  band 7 protein  57.57 
 
 		 304 aa  294  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.0000177218 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  43.19 
 
 		 300 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  43.29 
 
 		 304 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  43.16 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  43.29 
 
 		 304 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  43.29 
 
 		 304 aa  247  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  43.48 
 
 		 295 aa  242  7e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  40.78 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  42.61 
 
 		 292 aa  232  6e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  40.68 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  40.28 
 
 		 289 aa  226  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  40.28 
 
 		 289 aa  226  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2600  HflC protein  42.62 
 
 		 300 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.558304  normal  0.617958 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2299  HflC protein  41.67 
 
 		 299 aa  225  7e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783703  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1178  HflC protein  40.72 
 
 		 301 aa  225  9e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1098  HflC protein  40 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0072  HflC protein  42 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.055112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  39.93 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  40.48 
 
 		 293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2195  HflC protein  40.46 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1432  HflC protein  41 
 
 		 299 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200171  normal  0.890554 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1880  HflC protein  40.6 
 
 		 299 aa  206  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5011  HflC protein  37.84 
 
 		 296 aa  205  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  40.25 
 
 		 294 aa  202  7e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  38.35 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  37.19 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  35.53 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  36.33 
 
 		 298 aa  179  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  35.99 
 
 		 289 aa  179  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  35.19 
 
 		 304 aa  177  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  37.23 
 
 		 289 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  37.23 
 
 		 289 aa  175  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  40.42 
 
 		 287 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  34.46 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  36.82 
 
 		 292 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  35.54 
 
 		 293 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  36.18 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  34.02 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  35.25 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  35.62 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  35.62 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  35.62 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  34.35 
 
 		 292 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  40.32 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  34.66 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  35.03 
 
 		 294 aa  169  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0638  HflC protein  37.59 
 
 		 289 aa  169  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  40 
 
 		 289 aa  169  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  33.22 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0549  membrane protease subunit HflC  36.12 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  33.22 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  36.43 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  36.55 
 
 		 300 aa  166  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  38.21 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  36.63 
 
 		 287 aa  166  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  34.92 
 
 		 297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  34.92 
 
 		 297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  34.92 
 
 		 297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  34.92 
 
 		 297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  32.94 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  32.94 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0525  membrane protease subunit HflC  35.74 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  32.94 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  34.27 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  40 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  37.94 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  33.92 
 
 		 300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  33.1 
 
 		 291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04042  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  34.47 
 
 		 334 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.040502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3818  HflC protein  34.47 
 
 		 334 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5691  FtsH protease regulator HflC  34.47 
 
 		 334 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4706  FtsH protease regulator HflC  34.47 
 
 		 334 aa  162  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4733  FtsH protease regulator HflC  34.47 
 
 		 334 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4646  FtsH protease regulator HflC  34.47 
 
 		 334 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175793 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3838  FtsH protease regulator HflC  34.47 
 
 		 334 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  31.62 
 
 		 293 aa  162  8.000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04004  hypothetical protein  34.47 
 
 		 334 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4417  FtsH protease regulator HflC  34.47 
 
 		 334 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  36.52 
 
 		 289 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  37.54 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  36.52 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  37.54 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  33.91 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0578  FtsH protease regulator HflC  33.73 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>