More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1742 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1742  HflC protein  100 
 
 		 299 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1715  HflC protein  99 
 
 		 299 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6275  HflC protein  92.98 
 
 		 299 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364844  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1804  HflC protein  92.98 
 
 		 299 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266909  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1828  HflC protein  92.71 
 
 		 300 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540549  normal  0.180131 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5105  membrane protein, HflC  92.31 
 
 		 299 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1471  band 7 protein  86.96 
 
 		 299 aa  482  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0967739  normal  0.234957 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2242  HflC protein  71.53 
 
 		 299 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.564384  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1826  ftsH protease activity modulator HflC  71.88 
 
 		 299 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1337  ftsH protease activity modulator HflC  71.88 
 
 		 299 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2219  HflC protein  71.88 
 
 		 299 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2346  HflC protein  71.88 
 
 		 299 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2181  HflC protein  71.88 
 
 		 299 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0070  ftsH protease activity modulator HflC  71.88 
 
 		 299 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216158  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1602  FtsH protease activity modulator HflC  62 
 
 		 300 aa  309  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155202  normal  0.359083 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1412  band 7 protein  61.03 
 
 		 304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.0000177218 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2533  band 7 protein  60.68 
 
 		 300 aa  296  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00510027  hitchhiker  0.0000246325 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  42.67 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  42.09 
 
 		 304 aa  250  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  42.81 
 
 		 303 aa  249  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  42.42 
 
 		 304 aa  245  6e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  42.09 
 
 		 304 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  42.67 
 
 		 295 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  42.25 
 
 		 292 aa  232  7.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  40.07 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  40 
 
 		 296 aa  228  9e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  40.64 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  40.28 
 
 		 289 aa  225  7e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  40.28 
 
 		 293 aa  223  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2299  HflC protein  41 
 
 		 299 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783703  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1178  HflC protein  40.2 
 
 		 301 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1098  HflC protein  39.47 
 
 		 301 aa  222  6e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2600  HflC protein  41.28 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.558304  normal  0.617958 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0072  HflC protein  41.12 
 
 		 302 aa  219  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.055112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1432  HflC protein  40.59 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200171  normal  0.890554 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  39.79 
 
 		 293 aa  210  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2195  HflC protein  40.13 
 
 		 301 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1880  HflC protein  40.6 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5011  HflC protein  37.84 
 
 		 296 aa  205  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  39.83 
 
 		 294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  39.07 
 
 		 284 aa  196  3e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  36.18 
 
 		 297 aa  182  6e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  35.67 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  40.83 
 
 		 287 aa  177  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  36.88 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  36.88 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  36.08 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  36.08 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  36.84 
 
 		 302 aa  176  5e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  36.61 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  36.59 
 
 		 293 aa  176  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  36.08 
 
 		 297 aa  176  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  35.99 
 
 		 298 aa  174  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0638  HflC protein  38.3 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  34.88 
 
 		 294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  34.04 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  34.01 
 
 		 292 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  40 
 
 		 297 aa  172  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  35.71 
 
 		 298 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  35.03 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0549  membrane protease subunit HflC  36.88 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  35.03 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  35.03 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  36.15 
 
 		 292 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  35.03 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  33.89 
 
 		 292 aa  170  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  35.99 
 
 		 308 aa  169  6e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  33.92 
 
 		 290 aa  168  9e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  33.92 
 
 		 290 aa  168  9e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  39.17 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  38.34 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0525  membrane protease subunit HflC  36.5 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  32.65 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  34.35 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  35.86 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  37.96 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  35.45 
 
 		 328 aa  166  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  40 
 
 		 289 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  35.33 
 
 		 325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  33.45 
 
 		 291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  36.88 
 
 		 289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  36.88 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  35.99 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  31.93 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  35.76 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  31.93 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  31.93 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  35.99 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  36.46 
 
 		 286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  32.99 
 
 		 290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  33.79 
 
 		 292 aa  162  6e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0358  FtsH protease regulator HflC  33.33 
 
 		 334 aa  162  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  hitchhiker  0.00397927 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  35.71 
 
 		 300 aa  162  7e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  37.3 
 
 		 287 aa  162  9e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  36.97 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  36.97 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  33.13 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0578  FtsH protease regulator HflC  33.84 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  36.97 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4646  FtsH protease regulator HflC  33.56 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>