More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1283 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  100 
 
 		 289 aa  579  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  93.43 
 
 		 289 aa  546  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  61.84 
 
 		 304 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  61.27 
 
 		 300 aa  364  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  60.21 
 
 		 303 aa  363  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  62.9 
 
 		 304 aa  360  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  62.54 
 
 		 304 aa  358  5e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  58.87 
 
 		 295 aa  347  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  57.75 
 
 		 293 aa  341  7e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  57.84 
 
 		 296 aa  340  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  56.1 
 
 		 295 aa  336  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  59.12 
 
 		 292 aa  332  6e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  55.8 
 
 		 293 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1178  HflC protein  54.51 
 
 		 301 aa  308  5.9999999999999995e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  54.62 
 
 		 294 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1098  HflC protein  56.72 
 
 		 301 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2299  HflC protein  51.39 
 
 		 299 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783703  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0072  HflC protein  52.08 
 
 		 302 aa  296  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.055112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5011  HflC protein  54.92 
 
 		 296 aa  293  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2195  HflC protein  54.14 
 
 		 301 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2600  HflC protein  52.06 
 
 		 300 aa  293  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.558304  normal  0.617958 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1880  HflC protein  51.5 
 
 		 299 aa  293  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1432  HflC protein  54.55 
 
 		 299 aa  292  5e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200171  normal  0.890554 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  49.29 
 
 		 284 aa  279  3e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  48.7 
 
 		 304 aa  249  5e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  46.18 
 
 		 298 aa  248  6e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  42.96 
 
 		 289 aa  240  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  43.77 
 
 		 294 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  44.4 
 
 		 287 aa  232  6e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  43.51 
 
 		 292 aa  229  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  42.8 
 
 		 302 aa  229  6e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  43.32 
 
 		 292 aa  228  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  43.01 
 
 		 289 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1602  FtsH protease activity modulator HflC  45.11 
 
 		 300 aa  226  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155202  normal  0.359083 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2533  band 7 protein  44.36 
 
 		 300 aa  225  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00510027  hitchhiker  0.0000246325 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1412  band 7 protein  44.24 
 
 		 304 aa  224  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.0000177218 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  44.78 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  42.31 
 
 		 289 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  39.93 
 
 		 293 aa  221  9e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  41.16 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  43.66 
 
 		 289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  41.81 
 
 		 297 aa  219  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  42.65 
 
 		 295 aa  219  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1715  HflC protein  40.99 
 
 		 299 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  41.46 
 
 		 297 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  41.46 
 
 		 297 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  41.61 
 
 		 297 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  41.61 
 
 		 297 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  41.61 
 
 		 297 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  41.61 
 
 		 297 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  43.66 
 
 		 289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  40.77 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  44.41 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  44.41 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  40.07 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5105  membrane protein, HflC  40.64 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1828  HflC protein  40.28 
 
 		 300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540549  normal  0.180131 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  38.33 
 
 		 291 aa  213  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  39.58 
 
 		 297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  38.36 
 
 		 288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  45 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  41.87 
 
 		 291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1742  HflC protein  40.28 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  42.91 
 
 		 289 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  41.16 
 
 		 292 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  42.91 
 
 		 289 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1804  HflC protein  40.28 
 
 		 299 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266909  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6275  HflC protein  40.28 
 
 		 299 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364844  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  40.21 
 
 		 294 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  43.71 
 
 		 289 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  40.96 
 
 		 292 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  39.22 
 
 		 294 aa  209  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  42.8 
 
 		 297 aa  210  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0638  HflC protein  43.6 
 
 		 289 aa  209  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2242  HflC protein  43.23 
 
 		 299 aa  206  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.564384  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  40 
 
 		 308 aa  202  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0070  ftsH protease activity modulator HflC  43.61 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216158  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1337  ftsH protease activity modulator HflC  43.61 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2219  HflC protein  43.61 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2346  HflC protein  43.61 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2181  HflC protein  43.61 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  39.58 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1471  band 7 protein  39.22 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0967739  normal  0.234957 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  39.58 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1826  ftsH protease activity modulator HflC  43.61 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  38.68 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  38.28 
 
 		 295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  38.33 
 
 		 293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  37.72 
 
 		 290 aa  199  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02635  HflC protein  38.41 
 
 		 282 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  36.33 
 
 		 289 aa  194  1e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1786  integral membrane proteinase  39.93 
 
 		 287 aa  193  3e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1721  HflC protein  40.14 
 
 		 287 aa  193  4e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2010  HflC protein  42.22 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0721507  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  36.3 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  36.06 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  36.06 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  36.06 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  42.59 
 
 		 283 aa  189  4e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0549  membrane protease subunit HflC  35.4 
 
 		 304 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>