More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1562 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  100 
 
 		 290 aa  592  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  100 
 
 		 290 aa  592  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  43.21 
 
 		 292 aa  252  5.000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  43.53 
 
 		 295 aa  244  9e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  43.68 
 
 		 293 aa  243  3e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  45.96 
 
 		 293 aa  231  8.000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  42.75 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  39.5 
 
 		 284 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  38.79 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1721  HflC protein  40.21 
 
 		 287 aa  218  7e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1786  integral membrane proteinase  40.21 
 
 		 287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  41.31 
 
 		 300 aa  216  5e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  37.23 
 
 		 283 aa  215  9e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  40.14 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  39.58 
 
 		 289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  39.05 
 
 		 282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  39.86 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  40.61 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02635  HflC protein  40 
 
 		 282 aa  209  6e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  38.67 
 
 		 304 aa  208  9e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  38.27 
 
 		 289 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  40.23 
 
 		 287 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  37.36 
 
 		 290 aa  206  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  37.82 
 
 		 289 aa  206  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  39.93 
 
 		 297 aa  205  8e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  36.33 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  41.63 
 
 		 304 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  41.25 
 
 		 304 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  37.72 
 
 		 328 aa  202  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  38.89 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0002  HflC protein  36.05 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  40.14 
 
 		 289 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  40.14 
 
 		 289 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  35.74 
 
 		 318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  40.6 
 
 		 287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  37.25 
 
 		 325 aa  199  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  36.52 
 
 		 293 aa  199  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  36.73 
 
 		 294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3015  HflC protein  37.5 
 
 		 287 aa  198  9e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.698845  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  37.82 
 
 		 300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  41.73 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  39.05 
 
 		 293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  37.69 
 
 		 282 aa  196  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1178  HflC protein  40.71 
 
 		 301 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  36.62 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  40.71 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  36.49 
 
 		 298 aa  193  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  35.99 
 
 		 320 aa  192  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1432  HflC protein  40.88 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200171  normal  0.890554 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1098  HflC protein  40.59 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  35.64 
 
 		 316 aa  190  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  40.98 
 
 		 289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  37.04 
 
 		 296 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  35.64 
 
 		 313 aa  189  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  35.77 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0702  HflC protein  35.85 
 
 		 310 aa  189  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5011  HflC protein  40.07 
 
 		 296 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  35.76 
 
 		 292 aa  189  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  33.81 
 
 		 308 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  35.5 
 
 		 294 aa  189  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  33.92 
 
 		 311 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0072  HflC protein  39.08 
 
 		 302 aa  188  9e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.055112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2195  HflC protein  40.22 
 
 		 301 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  35.76 
 
 		 292 aa  188  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0638  HflC protein  40.77 
 
 		 289 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  35.84 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0538  FtsH protease regulator HflC  33.44 
 
 		 331 aa  186  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255691  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2299  HflC protein  36.62 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783703  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  40.77 
 
 		 289 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  35.58 
 
 		 295 aa  186  6e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2010  HflC protein  38.16 
 
 		 293 aa  185  7e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0721507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  40.42 
 
 		 289 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  40.42 
 
 		 289 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  33.7 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  35.76 
 
 		 292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  29.54 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  35.34 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  35.34 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  32.49 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0264  HflC protein  37.96 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  33.71 
 
 		 298 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  34.83 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  29.63 
 
 		 290 aa  180  2e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2600  HflC protein  39.26 
 
 		 300 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.558304  normal  0.617958 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  35.21 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0495  FtsH protease regulator HflC  33.88 
 
 		 331 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  40.29 
 
 		 289 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  33.57 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  32.72 
 
 		 335 aa  178  8e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2263  HflC protein  32.34 
 
 		 310 aa  178  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00649366  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  39.93 
 
 		 289 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  33.8 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  34.48 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  34.48 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1880  HflC protein  37.59 
 
 		 299 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  33.79 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  34.51 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  34.69 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  34.01 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  33.22 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>