More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1980 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1980  hflC protein  100 
 
 
287 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  55.76 
 
 
302 aa  329  3e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  52.54 
 
 
284 aa  311  4.999999999999999e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  53.51 
 
 
304 aa  306  3e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  53.36 
 
 
289 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  55.93 
 
 
294 aa  301  9e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  52.79 
 
 
295 aa  298  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  51.59 
 
 
292 aa  296  3e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  53.02 
 
 
298 aa  296  4e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  54.58 
 
 
293 aa  294  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  52.4 
 
 
293 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  52.79 
 
 
294 aa  284  9e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  50.53 
 
 
293 aa  264  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  47.74 
 
 
289 aa  262  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  48.08 
 
 
289 aa  262  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  45.36 
 
 
293 aa  262  4.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  48.31 
 
 
287 aa  260  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  46.69 
 
 
291 aa  258  9e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  48.5 
 
 
289 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  46.23 
 
 
292 aa  248  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  45.7 
 
 
294 aa  246  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  43.36 
 
 
297 aa  245  4.9999999999999997e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  41.61 
 
 
291 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  45.8 
 
 
292 aa  242  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  45.42 
 
 
295 aa  240  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  45.86 
 
 
289 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  44.41 
 
 
298 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  44.72 
 
 
303 aa  238  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  45.88 
 
 
297 aa  237  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  44.44 
 
 
289 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2010  HflC protein  47.52 
 
 
293 aa  237  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0721507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  47.16 
 
 
289 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  42.71 
 
 
289 aa  236  4e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  45.99 
 
 
289 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  46.81 
 
 
289 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  43.8 
 
 
300 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  46.24 
 
 
297 aa  235  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  45.3 
 
 
289 aa  235  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  45.3 
 
 
289 aa  235  8e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  44.79 
 
 
292 aa  234  9e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  45.52 
 
 
297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  43.11 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  45.52 
 
 
297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  44.07 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  45.52 
 
 
297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  45.52 
 
 
297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  45.88 
 
 
297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  45.88 
 
 
297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  44.93 
 
 
292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  47.08 
 
 
297 aa  233  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0638  HflC protein  47.31 
 
 
289 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  43.73 
 
 
304 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  43.35 
 
 
304 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  43.58 
 
 
308 aa  226  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  46.31 
 
 
295 aa  224  1e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0525  membrane protease subunit HflC  41.45 
 
 
304 aa  222  6e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00091  serine protease  38.12 
 
 
326 aa  222  6e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  41.11 
 
 
288 aa  222  7e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0549  membrane protease subunit HflC  41.09 
 
 
304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002262  HflC protein  38.12 
 
 
326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00114995  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04042  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  36.74 
 
 
334 aa  215  5e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.040502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3818  HflC protein  36.74 
 
 
334 aa  215  5e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5691  FtsH protease regulator HflC  36.74 
 
 
334 aa  215  5e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4733  FtsH protease regulator HflC  36.74 
 
 
334 aa  215  5e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  41.22 
 
 
290 aa  215  5e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4417  FtsH protease regulator HflC  36.74 
 
 
334 aa  215  5e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4706  FtsH protease regulator HflC  36.74 
 
 
334 aa  215  5e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3838  FtsH protease regulator HflC  36.74 
 
 
334 aa  215  5e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04004  hypothetical protein  36.74 
 
 
334 aa  215  5e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  41.22 
 
 
290 aa  215  5e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4646  FtsH protease regulator HflC  36.74 
 
 
334 aa  215  5e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.175793 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  38.28 
 
 
331 aa  215  9e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  38.25 
 
 
335 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4761  FtsH protease regulator HflC  36.77 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4632  FtsH protease regulator HflC  36.77 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4782  FtsH protease regulator HflC  36.77 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  0.242 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4725  FtsH protease regulator HflC  36.77 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4642  FtsH protease regulator HflC  36.77 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  41.22 
 
 
283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  39.07 
 
 
290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  39.37 
 
 
300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0538  FtsH protease regulator HflC  37.5 
 
 
331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255691  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  41.15 
 
 
300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  37.92 
 
 
334 aa  212  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  37.92 
 
 
334 aa  212  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  37.92 
 
 
334 aa  212  4.9999999999999996e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  39.22 
 
 
318 aa  212  7e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0358  FtsH protease regulator HflC  37.22 
 
 
334 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  hitchhiker  0.00397927 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2761  hflC protein  38.26 
 
 
326 aa  211  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0386111  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  37.29 
 
 
331 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1098  HflC protein  41.37 
 
 
301 aa  209  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  37.85 
 
 
308 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1178  HflC protein  41.07 
 
 
301 aa  209  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  35.86 
 
 
294 aa  209  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  39.45 
 
 
296 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  38.27 
 
 
284 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0495  FtsH protease regulator HflC  36.84 
 
 
331 aa  206  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  39.76 
 
 
282 aa  206  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5011  HflC protein  41.3 
 
 
296 aa  206  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315968  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  38.55 
 
 
311 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>