More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2533 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2533  band 7 protein  100 
 
 		 300 aa  595  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00510027  hitchhiker  0.0000246325 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1602  FtsH protease activity modulator HflC  93.98 
 
 		 300 aa  494  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155202  normal  0.359083 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1412  band 7 protein  74.41 
 
 		 304 aa  411  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.0000177218 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1715  HflC protein  60.42 
 
 		 299 aa  325  6e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1742  HflC protein  60.42 
 
 		 299 aa  324  9e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5105  membrane protein, HflC  60.07 
 
 		 299 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1471  band 7 protein  60.68 
 
 		 299 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0967739  normal  0.234957 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1828  HflC protein  59.87 
 
 		 300 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540549  normal  0.180131 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6275  HflC protein  59.38 
 
 		 299 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364844  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1804  HflC protein  59.38 
 
 		 299 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266909  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2242  HflC protein  62.5 
 
 		 299 aa  309  5e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.564384  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1826  ftsH protease activity modulator HflC  61.46 
 
 		 299 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2181  HflC protein  61.46 
 
 		 299 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1337  ftsH protease activity modulator HflC  61.46 
 
 		 299 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127713  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2346  HflC protein  61.46 
 
 		 299 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0070  ftsH protease activity modulator HflC  61.46 
 
 		 299 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216158  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2219  HflC protein  61.46 
 
 		 299 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  43.67 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  44.56 
 
 		 303 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  44.3 
 
 		 304 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  43.01 
 
 		 289 aa  248  6e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  42.76 
 
 		 289 aa  248  7e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  44.63 
 
 		 304 aa  246  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  44.63 
 
 		 304 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  43 
 
 		 295 aa  239  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  41.28 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  40.75 
 
 		 292 aa  228  8e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1178  HflC protein  40.2 
 
 		 301 aa  225  8e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2600  HflC protein  42.03 
 
 		 300 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.558304  normal  0.617958 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1098  HflC protein  40.2 
 
 		 301 aa  222  7e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  39.12 
 
 		 293 aa  219  6e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  38.68 
 
 		 295 aa  218  8.999999999999998e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2299  HflC protein  39.06 
 
 		 299 aa  216  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783703  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0072  HflC protein  39.33 
 
 		 302 aa  212  7e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.055112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  42.03 
 
 		 293 aa  211  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2195  HflC protein  40.8 
 
 		 301 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1880  HflC protein  39.85 
 
 		 299 aa  205  8e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  39.54 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1432  HflC protein  39.64 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200171  normal  0.890554 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5011  HflC protein  38.18 
 
 		 296 aa  202  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  39.07 
 
 		 284 aa  202  8e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  36.9 
 
 		 289 aa  191  9e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  35.45 
 
 		 292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  36.91 
 
 		 292 aa  180  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  35.97 
 
 		 302 aa  179  5.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  34 
 
 		 292 aa  177  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  35.15 
 
 		 297 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  35.15 
 
 		 297 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  35.15 
 
 		 297 aa  175  9e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  34.93 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  37.2 
 
 		 308 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  37.94 
 
 		 289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  34.69 
 
 		 298 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  36.1 
 
 		 292 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  34.19 
 
 		 294 aa  172  9e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  33.56 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  33.56 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  33.56 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  33.56 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  37.23 
 
 		 289 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  38.02 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  34.14 
 
 		 298 aa  170  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  36.09 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  34.25 
 
 		 292 aa  169  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  32.98 
 
 		 304 aa  167  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  34.8 
 
 		 294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  36.59 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  31.72 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  34.01 
 
 		 334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  34.01 
 
 		 334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  34.01 
 
 		 334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0638  HflC protein  37.89 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  35.44 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  35.44 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  34.46 
 
 		 287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  38.6 
 
 		 289 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  38.6 
 
 		 289 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  38.72 
 
 		 289 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  38.6 
 
 		 289 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  32.65 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  38.38 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  35.14 
 
 		 286 aa  160  3e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  38.38 
 
 		 289 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  33.57 
 
 		 318 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  34.48 
 
 		 290 aa  159  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  36.99 
 
 		 292 aa  159  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  34.07 
 
 		 295 aa  159  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  36.63 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0578  FtsH protease regulator HflC  31.75 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  32.87 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  31.86 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  32.42 
 
 		 335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  35.64 
 
 		 293 aa  155  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  32.07 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  32.63 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  32.66 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  29.17 
 
 		 290 aa  152  7e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3818  HflC protein  32.27 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  34.14 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  32.78 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>