More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2039 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  100 
 
 		 318 aa  634    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  92.07 
 
 		 311 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  89.31 
 
 		 308 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  84.16 
 
 		 300 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  77.56 
 
 		 299 aa  475  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  79.21 
 
 		 298 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  79.31 
 
 		 311 aa  461  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  66.55 
 
 		 300 aa  391  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  57.93 
 
 		 312 aa  331  9e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  57.89 
 
 		 290 aa  328  7e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  57.35 
 
 		 295 aa  312  3.9999999999999997e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  48.87 
 
 		 328 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  48.37 
 
 		 320 aa  295  5e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  48.54 
 
 		 325 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  47.28 
 
 		 316 aa  288  6e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  47.45 
 
 		 313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0702  HflC protein  51.32 
 
 		 310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  46.88 
 
 		 292 aa  268  8e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  50.17 
 
 		 293 aa  268  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  45.96 
 
 		 281 aa  251  9.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  47.89 
 
 		 294 aa  251  9.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  45.14 
 
 		 300 aa  249  5e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  39.49 
 
 		 289 aa  245  6.999999999999999e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0832  hflC protein  44.53 
 
 		 290 aa  243  3.9999999999999997e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.379816  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  39.64 
 
 		 290 aa  242  5e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  44 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0356  HflC protein  42.19 
 
 		 340 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.534146  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2000  HflC protein  42.19 
 
 		 340 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3385  HflC protein  41.26 
 
 		 306 aa  239  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  41.82 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3671  HflC protein  43.66 
 
 		 369 aa  233  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  42.24 
 
 		 284 aa  232  7.000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0886  HflC protein  44.44 
 
 		 340 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.340526 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  42.46 
 
 		 289 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  42.5 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2735  protein hflC  44.15 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0491808  normal  0.0307139 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  42.03 
 
 		 286 aa  229  5e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  40.79 
 
 		 284 aa  229  7e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  40.2 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  41.94 
 
 		 292 aa  224  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3172  HflC protein  43.45 
 
 		 300 aa  223  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  41 
 
 		 283 aa  222  7e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  39.16 
 
 		 302 aa  222  7e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  39.38 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  42.81 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  44.11 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  42.76 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  39.27 
 
 		 295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1795  HflC protein  43.84 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  38.28 
 
 		 283 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  38.28 
 
 		 283 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1396  hflC protein  41.98 
 
 		 300 aa  215  7e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685975  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1352  HflC protein  41.98 
 
 		 300 aa  215  7e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  41.22 
 
 		 289 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  41.64 
 
 		 287 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  40.86 
 
 		 289 aa  209  7e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  42.86 
 
 		 289 aa  208  9e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  39.53 
 
 		 282 aa  208  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  42.18 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  42.51 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  38.6 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2799  HflC protein  43.01 
 
 		 321 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.565333 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  40.14 
 
 		 293 aa  206  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2816  HFLC protein  42.81 
 
 		 305 aa  205  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.273715  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  40.3 
 
 		 287 aa  203  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  41.13 
 
 		 289 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2540  HflC protein  42.49 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713322  normal  0.756997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  41.34 
 
 		 289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  35.74 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  41.46 
 
 		 289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  41.46 
 
 		 289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  37.32 
 
 		 281 aa  199  5e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0264  HflC protein  39.51 
 
 		 282 aa  199  7e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2017  HflC protein  41.53 
 
 		 310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  41.42 
 
 		 289 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  35.76 
 
 		 288 aa  196  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  37.5 
 
 		 292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  34.7 
 
 		 286 aa  196  5.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  37.59 
 
 		 295 aa  196  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  35.71 
 
 		 300 aa  196  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  36.11 
 
 		 291 aa  196  6e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  36.21 
 
 		 293 aa  195  7e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  37.8 
 
 		 297 aa  195  7e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  37.76 
 
 		 297 aa  195  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1748  HflC protein  44.59 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.224393  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0638  HflC protein  41.49 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  38.21 
 
 		 303 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  37.76 
 
 		 292 aa  192  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3332  band 7 protein  41.64 
 
 		 283 aa  192  7e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.453043  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2248  band 7 protein  39.46 
 
 		 283 aa  192  9e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  35.4 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  37.8 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  37.8 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  35.74 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  35.74 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  33.74 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  33.74 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  33.74 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  37.63 
 
 		 296 aa  189  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  35.47 
 
 		 298 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>