More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0604 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  589  1e-167  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  70.07 
 
 		 292 aa  428  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  70.88 
 
 		 295 aa  425  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  68.62 
 
 		 294 aa  409  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  66.1 
 
 		 293 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  57.19 
 
 		 304 aa  338  4e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  55.8 
 
 		 289 aa  326  2.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  53.58 
 
 		 300 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  54.55 
 
 		 303 aa  325  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  57.29 
 
 		 304 aa  325  6e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  54.71 
 
 		 289 aa  325  6e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  57.64 
 
 		 304 aa  325  6e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  55.16 
 
 		 284 aa  323  3e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  54.17 
 
 		 298 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  48.79 
 
 		 295 aa  296  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  50.17 
 
 		 289 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  49.1 
 
 		 302 aa  291  9e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0072  HflC protein  49.32 
 
 		 302 aa  288  9e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.055112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1178  HflC protein  49.65 
 
 		 301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  52.63 
 
 		 287 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  49.65 
 
 		 304 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  46.92 
 
 		 293 aa  280  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2299  HflC protein  48.25 
 
 		 299 aa  279  4e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783703  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1098  HflC protein  50 
 
 		 301 aa  278  6e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5011  HflC protein  50 
 
 		 296 aa  278  8e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  48.06 
 
 		 296 aa  278  9e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1432  HflC protein  51.46 
 
 		 299 aa  277  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200171  normal  0.890554 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  46.24 
 
 		 291 aa  275  8e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2195  HflC protein  52.06 
 
 		 301 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1880  HflC protein  50.38 
 
 		 299 aa  272  6e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  50.93 
 
 		 287 aa  268  7e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  48.61 
 
 		 289 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  46.99 
 
 		 294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  45.49 
 
 		 294 aa  265  5e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  47.57 
 
 		 289 aa  265  8e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2600  HflC protein  49.45 
 
 		 300 aa  265  8e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.558304  normal  0.617958 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  50 
 
 		 289 aa  262  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  47.2 
 
 		 291 aa  259  4e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  44.18 
 
 		 297 aa  258  7e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  44.18 
 
 		 297 aa  258  7e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  44.59 
 
 		 297 aa  257  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  44.03 
 
 		 297 aa  256  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  44.95 
 
 		 293 aa  256  5e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0549  membrane protease subunit HflC  43.73 
 
 		 304 aa  255  6e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  43.6 
 
 		 292 aa  254  8e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  43.34 
 
 		 298 aa  254  9e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  46.49 
 
 		 292 aa  254  9e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  50.9 
 
 		 289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  49.44 
 
 		 289 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  50.54 
 
 		 289 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0525  membrane protease subunit HflC  43.73 
 
 		 304 aa  253  3e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  44.52 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  42.66 
 
 		 292 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  42.56 
 
 		 292 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  48.1 
 
 		 289 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  48.1 
 
 		 289 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  48.77 
 
 		 289 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  41.11 
 
 		 294 aa  246  3e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  40.62 
 
 		 288 aa  246  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  44.32 
 
 		 295 aa  246  4e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  42.66 
 
 		 297 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  42.66 
 
 		 297 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  42.66 
 
 		 297 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  42.66 
 
 		 297 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  42.46 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0638  HflC protein  47.92 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  41.11 
 
 		 295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02635  HflC protein  44.17 
 
 		 282 aa  236  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  45.96 
 
 		 290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  43.62 
 
 		 290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  45.96 
 
 		 290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  41.3 
 
 		 308 aa  231  9e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2010  HflC protein  43.71 
 
 		 293 aa  231  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0721507  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  39.86 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  43.97 
 
 		 284 aa  228  6e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  42.81 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  37.23 
 
 		 331 aa  226  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  42.86 
 
 		 300 aa  226  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  36.92 
 
 		 331 aa  225  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00091  serine protease  37.46 
 
 		 326 aa  225  6e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3015  HflC protein  42.96 
 
 		 287 aa  225  6e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.698845  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002262  HflC protein  36.99 
 
 		 326 aa  225  8e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00114995  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2761  hflC protein  36.84 
 
 		 326 aa  224  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0386111  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1721  HflC protein  42.2 
 
 		 287 aa  222  7e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1786  integral membrane proteinase  42.2 
 
 		 287 aa  222  7e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  36.31 
 
 		 334 aa  221  9e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  36.31 
 
 		 334 aa  221  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  36.31 
 
 		 334 aa  221  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  36.28 
 
 		 335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  41.3 
 
 		 292 aa  219  5e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  40.94 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  41.05 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  37.59 
 
 		 289 aa  217  2e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  42.09 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  43.56 
 
 		 283 aa  216  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  39.35 
 
 		 312 aa  216  5e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  42.28 
 
 		 299 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  41.05 
 
 		 283 aa  215  7e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  42.86 
 
 		 311 aa  215  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  40.86 
 
 		 311 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>