More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1941 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  100 
 
 		 294 aa  584  1e-166  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  76.14 
 
 		 289 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  49.1 
 
 		 302 aa  285  5.999999999999999e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  47.54 
 
 		 295 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  48.77 
 
 		 293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  52.59 
 
 		 287 aa  277  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  50.95 
 
 		 294 aa  275  8e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  48.01 
 
 		 292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  51.47 
 
 		 304 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  45.65 
 
 		 284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  47.59 
 
 		 298 aa  270  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  46.4 
 
 		 293 aa  265  1e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  43.49 
 
 		 304 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  48.29 
 
 		 287 aa  250  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  43.37 
 
 		 289 aa  248  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  45.26 
 
 		 291 aa  246  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  42.21 
 
 		 304 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  46.98 
 
 		 289 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  41.87 
 
 		 304 aa  245  6e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  42.65 
 
 		 289 aa  245  6.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  41.55 
 
 		 291 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  42.76 
 
 		 300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  47.1 
 
 		 293 aa  242  5e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  46.26 
 
 		 289 aa  242  6e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  48.28 
 
 		 289 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  47.31 
 
 		 289 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  47.31 
 
 		 289 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  43.25 
 
 		 297 aa  238  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  46.59 
 
 		 289 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  41.05 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2010  HflC protein  46.91 
 
 		 293 aa  236  4e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0721507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  46.24 
 
 		 289 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  46.24 
 
 		 289 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  42.75 
 
 		 303 aa  235  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  40.77 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  40.69 
 
 		 288 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  46.21 
 
 		 289 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  40.99 
 
 		 290 aa  231  8.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  42.66 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  43.54 
 
 		 297 aa  229  6e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  43.54 
 
 		 297 aa  229  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  42.86 
 
 		 297 aa  228  7e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  43.2 
 
 		 297 aa  228  7e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  41.44 
 
 		 292 aa  228  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0638  HflC protein  46.4 
 
 		 289 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  40.29 
 
 		 300 aa  224  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  42.52 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  42.52 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  42.52 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  42.52 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  42.01 
 
 		 295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  41.38 
 
 		 298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  41.46 
 
 		 295 aa  222  7e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3015  HflC protein  40.5 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.698845  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  41.9 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  40.21 
 
 		 295 aa  221  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  38.97 
 
 		 320 aa  219  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  42.7 
 
 		 292 aa  219  6e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  39.58 
 
 		 325 aa  218  7e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  43.6 
 
 		 297 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02635  HflC protein  40.57 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  40.07 
 
 		 296 aa  216  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  39.86 
 
 		 316 aa  216  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  39.51 
 
 		 313 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  42.07 
 
 		 318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0525  membrane protease subunit HflC  38.89 
 
 		 304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1786  integral membrane proteinase  38.85 
 
 		 287 aa  212  5.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1721  HflC protein  38.85 
 
 		 287 aa  212  7e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00091  serine protease  37.85 
 
 		 326 aa  212  7e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0549  membrane protease subunit HflC  38.52 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  38.73 
 
 		 294 aa  209  5e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  38.46 
 
 		 292 aa  209  5e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  43.06 
 
 		 308 aa  209  6e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  39.45 
 
 		 300 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  39.5 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  39.72 
 
 		 311 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2600  HflC protein  36.82 
 
 		 300 aa  205  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.558304  normal  0.617958 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  39.85 
 
 		 299 aa  205  7e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  43.22 
 
 		 283 aa  205  8e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  38.63 
 
 		 281 aa  205  8e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2761  hflC protein  36.79 
 
 		 326 aa  204  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0386111  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1178  HflC protein  37.71 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  39.05 
 
 		 298 aa  203  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002262  HflC protein  37.58 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00114995  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  41.13 
 
 		 283 aa  202  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1098  HflC protein  38.67 
 
 		 301 aa  202  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5011  HflC protein  38.01 
 
 		 296 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  38.41 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1880  HflC protein  37.64 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  40.79 
 
 		 282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  37.82 
 
 		 286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  34.98 
 
 		 328 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  39.93 
 
 		 311 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1432  HflC protein  37.68 
 
 		 299 aa  198  9e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200171  normal  0.890554 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2299  HflC protein  36.05 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783703  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3818  HflC protein  37.5 
 
 		 334 aa  196  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4733  FtsH protease regulator HflC  37.5 
 
 		 334 aa  196  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4706  FtsH protease regulator HflC  37.5 
 
 		 334 aa  196  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4417  FtsH protease regulator HflC  37.5 
 
 		 334 aa  196  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4646  FtsH protease regulator HflC  37.5 
 
 		 334 aa  196  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>