More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02635 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02635  HflC protein  100 
 
 
282 aa  566  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3015  HflC protein  85.11 
 
 
287 aa  499  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.698845  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1721  HflC protein  82.5 
 
 
287 aa  477  1e-133  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1786  integral membrane proteinase  82.5 
 
 
287 aa  477  1e-133  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  45.09 
 
 
284 aa  242  5e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  43.77 
 
 
295 aa  241  7.999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  44.84 
 
 
289 aa  236  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  41.64 
 
 
293 aa  229  4e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  43.21 
 
 
298 aa  225  8e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  44.17 
 
 
293 aa  224  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  40.77 
 
 
292 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  40.62 
 
 
294 aa  223  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  38.79 
 
 
292 aa  223  4e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  42.8 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  45.15 
 
 
287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  44.64 
 
 
293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  41.87 
 
 
297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  40.42 
 
 
292 aa  218  7e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  42.55 
 
 
302 aa  218  7e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  40.97 
 
 
297 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  44.77 
 
 
291 aa  218  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  39.86 
 
 
297 aa  217  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  41.87 
 
 
297 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  41.87 
 
 
297 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  43.97 
 
 
289 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  41.4 
 
 
292 aa  217  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  43.07 
 
 
292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  39.37 
 
 
292 aa  215  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  40.97 
 
 
297 aa  215  7e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  40.97 
 
 
297 aa  215  7e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  40.97 
 
 
297 aa  215  7e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  40.97 
 
 
297 aa  215  7e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  45.91 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  41.2 
 
 
294 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  42.21 
 
 
294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  45.55 
 
 
289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  42.55 
 
 
298 aa  212  7e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  42.91 
 
 
289 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  43.54 
 
 
289 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  39.78 
 
 
295 aa  210  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  42.21 
 
 
297 aa  210  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0638  HflC protein  45.26 
 
 
289 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  38.79 
 
 
291 aa  210  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  42.8 
 
 
289 aa  209  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  40.43 
 
 
293 aa  209  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  43.86 
 
 
289 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  43.86 
 
 
289 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  44.13 
 
 
289 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2010  HflC protein  38.71 
 
 
293 aa  203  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0721507  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  38.16 
 
 
288 aa  202  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00091  serine protease  36.91 
 
 
326 aa  202  7e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  42.31 
 
 
304 aa  201  9e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2761  hflC protein  37.54 
 
 
326 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0386111  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  42.31 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002262  HflC protein  36.99 
 
 
326 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00114995  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  39.72 
 
 
290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  37.69 
 
 
334 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  37.69 
 
 
334 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  37.69 
 
 
334 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  38.03 
 
 
295 aa  200  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  39.86 
 
 
304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  39.65 
 
 
295 aa  199  6e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  37.19 
 
 
294 aa  198  7e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  37.31 
 
 
335 aa  198  7.999999999999999e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  40.45 
 
 
300 aa  198  9e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  40 
 
 
290 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  35.94 
 
 
331 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  40 
 
 
290 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0549  membrane protease subunit HflC  37.87 
 
 
304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0578  FtsH protease regulator HflC  38.04 
 
 
333 aa  196  3e-49  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  38.71 
 
 
289 aa  196  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  37.2 
 
 
308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  40.14 
 
 
300 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  41.4 
 
 
328 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  38.41 
 
 
289 aa  196  5.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  38.71 
 
 
303 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0525  membrane protease subunit HflC  37.87 
 
 
304 aa  194  9e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  35 
 
 
331 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  40 
 
 
283 aa  194  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0538  FtsH protease regulator HflC  36.14 
 
 
331 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255691  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  40.7 
 
 
325 aa  193  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  40 
 
 
284 aa  192  5e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04042  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  37.18 
 
 
334 aa  191  9e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.040502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3818  HflC protein  37.18 
 
 
334 aa  191  9e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04004  hypothetical protein  37.18 
 
 
334 aa  191  9e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4646  FtsH protease regulator HflC  37.18 
 
 
334 aa  191  9e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.175793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5691  FtsH protease regulator HflC  37.18 
 
 
334 aa  191  9e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4733  FtsH protease regulator HflC  37.18 
 
 
334 aa  191  9e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4706  FtsH protease regulator HflC  37.18 
 
 
334 aa  191  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3838  FtsH protease regulator HflC  37.18 
 
 
334 aa  191  9e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4417  FtsH protease regulator HflC  37.18 
 
 
334 aa  191  9e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  39.44 
 
 
294 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4782  FtsH protease regulator HflC  37.5 
 
 
334 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  0.242 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4642  FtsH protease regulator HflC  37.5 
 
 
334 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4632  FtsH protease regulator HflC  37.5 
 
 
334 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4725  FtsH protease regulator HflC  37.5 
 
 
334 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4761  FtsH protease regulator HflC  37.5 
 
 
334 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  39.16 
 
 
320 aa  188  7e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  38.52 
 
 
286 aa  187  2e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  38.6 
 
 
316 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.267381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>