More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2657 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  100 
 
 		 316 aa  632  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  99.04 
 
 		 313 aa  614  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  91.88 
 
 		 320 aa  591  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  77.36 
 
 		 325 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  70.37 
 
 		 328 aa  430  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0702  HflC protein  72.35 
 
 		 310 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  53.61 
 
 		 300 aa  313  3.9999999999999997e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  51.75 
 
 		 308 aa  295  7e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  49.48 
 
 		 300 aa  292  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  50.35 
 
 		 299 aa  291  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  50.53 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  51.46 
 
 		 298 aa  287  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  48.14 
 
 		 318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  50.73 
 
 		 311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  49.32 
 
 		 312 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  47.96 
 
 		 290 aa  280  3e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  50 
 
 		 295 aa  268  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  48.62 
 
 		 293 aa  246  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  46.23 
 
 		 292 aa  245  8e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1352  HflC protein  45.7 
 
 		 300 aa  232  6e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1396  hflC protein  45.7 
 
 		 300 aa  232  6e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685975  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  39.53 
 
 		 290 aa  228  7e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  40.28 
 
 		 289 aa  228  1e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  42.16 
 
 		 293 aa  226  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3385  HflC protein  40.21 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1795  HflC protein  44.64 
 
 		 300 aa  223  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  42.23 
 
 		 294 aa  223  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2000  HflC protein  42.52 
 
 		 340 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0356  HflC protein  42.52 
 
 		 340 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.534146  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  41.7 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  43.89 
 
 		 300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0832  hflC protein  42.55 
 
 		 290 aa  218  7e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.379816  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0886  HflC protein  42.18 
 
 		 340 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.340526 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  40.14 
 
 		 289 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  42.03 
 
 		 281 aa  216  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2735  protein hflC  40.89 
 
 		 297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0491808  normal  0.0307139 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  41.84 
 
 		 284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  40 
 
 		 294 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  40.07 
 
 		 284 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1748  HflC protein  46.05 
 
 		 328 aa  212  7e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.224393  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3172  HflC protein  41.46 
 
 		 300 aa  212  9e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  40.2 
 
 		 298 aa  211  9e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  40.14 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  41.22 
 
 		 302 aa  211  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  38.54 
 
 		 282 aa  210  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  38.28 
 
 		 295 aa  209  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  38.14 
 
 		 292 aa  209  4e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3671  HflC protein  42.16 
 
 		 369 aa  208  8e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2799  HflC protein  41.72 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.565333 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  39.54 
 
 		 283 aa  206  5e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  39.54 
 
 		 283 aa  206  5e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  38.51 
 
 		 297 aa  202  5e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  38.95 
 
 		 304 aa  202  6e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2540  HflC protein  42.14 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713322  normal  0.756997 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2017  HflC protein  41.38 
 
 		 310 aa  199  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  37.72 
 
 		 286 aa  199  7.999999999999999e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2816  HFLC protein  40.4 
 
 		 305 aa  198  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.273715  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  38.49 
 
 		 295 aa  198  9e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  37.97 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  39.8 
 
 		 289 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  39.18 
 
 		 291 aa  196  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  41.39 
 
 		 289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  40.78 
 
 		 289 aa  195  9e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  36.27 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  40.43 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  39.04 
 
 		 289 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  37.46 
 
 		 293 aa  192  5e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  38.75 
 
 		 287 aa  192  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  36.91 
 
 		 298 aa  192  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  35.66 
 
 		 295 aa  192  7e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  39.86 
 
 		 289 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0264  HflC protein  40.78 
 
 		 282 aa  190  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  37.28 
 
 		 304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  37.11 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  37.5 
 
 		 283 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  40.07 
 
 		 289 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  40.14 
 
 		 289 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  37.02 
 
 		 300 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  40.14 
 
 		 289 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  36.15 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02635  HflC protein  38.6 
 
 		 282 aa  187  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0638  HflC protein  40.41 
 
 		 289 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  38.46 
 
 		 287 aa  185  7e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  39.22 
 
 		 282 aa  185  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  38.16 
 
 		 304 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  38.06 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  35.47 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  35.47 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  36.84 
 
 		 289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  37.1 
 
 		 303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  35.4 
 
 		 297 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  35.4 
 
 		 297 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  35.4 
 
 		 297 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  35.4 
 
 		 297 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  35.23 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  34.03 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  36.73 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  34.83 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  35.64 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  37.85 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>