More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2816 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2816  HFLC protein  100 
 
 		 305 aa  605  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.273715  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2017  HflC protein  71.2 
 
 		 310 aa  421  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2799  HflC protein  65.53 
 
 		 321 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.565333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2540  HflC protein  66.55 
 
 		 319 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713322  normal  0.756997 
 
 
-
 
NC_004310  BR1396  hflC protein  63.42 
 
 		 300 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685975  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1352  HflC protein  63.42 
 
 		 300 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1795  HflC protein  63.42 
 
 		 300 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1748  HflC protein  65.77 
 
 		 328 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.224393  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  46.59 
 
 		 300 aa  231  8.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0923  putative HflC protein  46.83 
 
 		 290 aa  225  7e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  41.58 
 
 		 290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  41.3 
 
 		 294 aa  211  7.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  44.17 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  43.75 
 
 		 308 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2735  protein hflC  42.42 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0491808  normal  0.0307139 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  41.81 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  43.51 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  39.4 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  41.81 
 
 		 325 aa  207  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  42.81 
 
 		 311 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  42.71 
 
 		 318 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3172  HflC protein  41.78 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  40.51 
 
 		 320 aa  203  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  44.64 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  42.46 
 
 		 300 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  39.94 
 
 		 328 aa  202  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0356  HflC protein  39.58 
 
 		 340 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.534146  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2000  HflC protein  39.58 
 
 		 340 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  40.4 
 
 		 316 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  41.01 
 
 		 295 aa  198  9e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  39.74 
 
 		 313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0886  HflC protein  38.89 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.340526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  37.93 
 
 		 303 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  37.42 
 
 		 304 aa  186  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  36.15 
 
 		 292 aa  186  5e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  37.79 
 
 		 295 aa  186  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  40.27 
 
 		 293 aa  185  8e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  35.17 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3671  HflC protein  39.7 
 
 		 369 aa  183  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0702  HflC protein  40.37 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  36.98 
 
 		 283 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  37.19 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  36.24 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  34.8 
 
 		 292 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  36 
 
 		 297 aa  175  8e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  37.42 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  37.42 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  35.91 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  36.86 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  34.68 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  35.79 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  35.79 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  38.36 
 
 		 281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  34.45 
 
 		 297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  38.36 
 
 		 292 aa  172  5e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  34.13 
 
 		 308 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  34.47 
 
 		 292 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  34.38 
 
 		 292 aa  172  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  36.99 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  33.13 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  33.78 
 
 		 292 aa  170  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  36.59 
 
 		 289 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  34.46 
 
 		 288 aa  169  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  35.49 
 
 		 298 aa  169  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  32.84 
 
 		 331 aa  169  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  37.91 
 
 		 295 aa  168  8e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  36.49 
 
 		 296 aa  168  9e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  33.11 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  36.13 
 
 		 294 aa  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1178  HflC protein  36.09 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  35.09 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  34.46 
 
 		 298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  33.67 
 
 		 294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  35.23 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  34.45 
 
 		 297 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  35.21 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  34.45 
 
 		 297 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  34.45 
 
 		 297 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  34.45 
 
 		 297 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  34.62 
 
 		 295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  36.55 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  33.68 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  33.43 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1098  HflC protein  37.32 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04042  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  31.96 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.040502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3818  HflC protein  31.96 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0832  hflC protein  37.23 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.379816  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4706  FtsH protease regulator HflC  31.96 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3838  FtsH protease regulator HflC  31.96 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  32.32 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4646  FtsH protease regulator HflC  31.96 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175793 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04004  hypothetical protein  31.96 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4733  FtsH protease regulator HflC  31.96 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5691  FtsH protease regulator HflC  31.96 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  32.32 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  32.32 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4417  FtsH protease regulator HflC  31.96 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  31.54 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4761  FtsH protease regulator HflC  32.2 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4782  FtsH protease regulator HflC  32.2 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  0.242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>