More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3172 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3172  HflC protein  100 
 
 		 300 aa  584  1e-166  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2735  protein hflC  70.57 
 
 		 297 aa  383  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0491808  normal  0.0307139 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0356  HflC protein  61.05 
 
 		 340 aa  329  4e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.534146  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2000  HflC protein  61.05 
 
 		 340 aa  329  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  61.46 
 
 		 294 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0886  HflC protein  60.35 
 
 		 340 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.340526 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3671  HflC protein  61.98 
 
 		 369 aa  308  5.9999999999999995e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  46.01 
 
 		 290 aa  235  8e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  45.26 
 
 		 300 aa  228  8e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  45.45 
 
 		 311 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  44.76 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  43.93 
 
 		 318 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  42.72 
 
 		 325 aa  222  7e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  44.33 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  42.71 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  42.75 
 
 		 311 aa  215  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  43.86 
 
 		 328 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  41.46 
 
 		 316 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  41.46 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  41.11 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  43.6 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  45.22 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  42.86 
 
 		 298 aa  208  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  41.26 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  41.26 
 
 		 283 aa  205  8e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  39.72 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0702  HflC protein  43.49 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2816  HFLC protein  41.75 
 
 		 305 aa  201  8e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.273715  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  41.34 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1396  hflC protein  41.86 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685975  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1352  HflC protein  41.86 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  39.25 
 
 		 295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1795  HflC protein  43.9 
 
 		 300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  40.14 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  38.93 
 
 		 283 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  39.47 
 
 		 282 aa  196  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  36.78 
 
 		 334 aa  195  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  36.78 
 
 		 334 aa  195  9e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  36.78 
 
 		 334 aa  195  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  40.57 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  40.56 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_002978  WD0832  hflC protein  40.22 
 
 		 290 aa  194  2e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.379816  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  36.4 
 
 		 290 aa  194  2e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2799  HflC protein  42.27 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.565333 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  34.84 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  34.97 
 
 		 335 aa  192  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2017  HflC protein  43.14 
 
 		 310 aa  192  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  36.79 
 
 		 282 aa  191  9e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  38.87 
 
 		 283 aa  189  4e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  39.49 
 
 		 293 aa  189  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  38.93 
 
 		 297 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2540  HflC protein  42.51 
 
 		 319 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713322  normal  0.756997 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  35.31 
 
 		 331 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  36.68 
 
 		 293 aa  188  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  37.97 
 
 		 292 aa  188  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  38.85 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  38.28 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  35.31 
 
 		 331 aa  186  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  39.26 
 
 		 304 aa  186  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0578  FtsH protease regulator HflC  34.67 
 
 		 333 aa  186  5e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  38.97 
 
 		 281 aa  186  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002262  HflC protein  35.38 
 
 		 326 aa  185  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00114995  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  37.14 
 
 		 284 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  36.86 
 
 		 292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0264  HflC protein  38.33 
 
 		 282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  38.81 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  38.49 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  37.25 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  35.19 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  38.23 
 
 		 292 aa  183  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  35.42 
 
 		 294 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  37.25 
 
 		 297 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  37.25 
 
 		 297 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  37.8 
 
 		 308 aa  182  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0538  FtsH protease regulator HflC  34.05 
 
 		 331 aa  182  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255691  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  37.28 
 
 		 292 aa  182  7e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  37.07 
 
 		 283 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  37.07 
 
 		 283 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  34.92 
 
 		 295 aa  181  9.000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  36.07 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  34.56 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04042  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  34.52 
 
 		 334 aa  180  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.040502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3818  HflC protein  34.52 
 
 		 334 aa  180  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4733  FtsH protease regulator HflC  34.52 
 
 		 334 aa  180  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04004  hypothetical protein  34.52 
 
 		 334 aa  180  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5691  FtsH protease regulator HflC  34.52 
 
 		 334 aa  180  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3838  FtsH protease regulator HflC  34.52 
 
 		 334 aa  180  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4646  FtsH protease regulator HflC  34.52 
 
 		 334 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175793 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4706  FtsH protease regulator HflC  34.52 
 
 		 334 aa  180  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4417  FtsH protease regulator HflC  34.52 
 
 		 334 aa  180  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4642  FtsH protease regulator HflC  34.19 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4725  FtsH protease regulator HflC  34.19 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4632  FtsH protease regulator HflC  34.19 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4761  FtsH protease regulator HflC  34.19 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4782  FtsH protease regulator HflC  34.19 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  0.242 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  37.25 
 
 		 297 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  37.25 
 
 		 297 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  37.25 
 
 		 297 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  37.25 
 
 		 297 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00091  serine protease  34.16 
 
 		 326 aa  179  7e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>