More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0165 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  100 
 
 		 286 aa  573  1.0000000000000001e-162  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  49.45 
 
 		 290 aa  274  9e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  48.4 
 
 		 289 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0832  hflC protein  51.3 
 
 		 290 aa  265  7e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.379816  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  42.6 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  43.12 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  45.13 
 
 		 290 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  40.57 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  45.8 
 
 		 311 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  42.03 
 
 		 318 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  41.06 
 
 		 283 aa  229  6e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  40.66 
 
 		 284 aa  228  6e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  45.04 
 
 		 298 aa  228  6e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  42.34 
 
 		 300 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  43.51 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  40.94 
 
 		 297 aa  219  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  39.35 
 
 		 283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  42.59 
 
 		 282 aa  219  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  39.64 
 
 		 289 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  38.81 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  40.61 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  40.53 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  40.86 
 
 		 282 aa  208  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  38.43 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  38.57 
 
 		 292 aa  205  8e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  33.93 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  38.41 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  37.23 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  42.39 
 
 		 293 aa  202  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  37.86 
 
 		 295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  37.46 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  38.06 
 
 		 313 aa  199  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  40.36 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  37.72 
 
 		 316 aa  199  6e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  37.99 
 
 		 325 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  38.81 
 
 		 287 aa  196  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  37.93 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3385  HflC protein  38.26 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  35.66 
 
 		 291 aa  192  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0264  HflC protein  37.77 
 
 		 282 aa  192  5e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  37.86 
 
 		 293 aa  192  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  38.55 
 
 		 298 aa  192  6e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  37.68 
 
 		 281 aa  192  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0702  HflC protein  37.22 
 
 		 310 aa  192  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  36.14 
 
 		 320 aa  191  9e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  39.84 
 
 		 283 aa  191  9e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  39.84 
 
 		 283 aa  191  9e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  37.37 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  37.1 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2000  HflC protein  38.41 
 
 		 340 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0356  HflC protein  38.41 
 
 		 340 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.534146  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  36.14 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3671  HflC protein  39.69 
 
 		 369 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  38.96 
 
 		 283 aa  187  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02635  HflC protein  38.52 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3172  HflC protein  38.85 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  35.94 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  36.49 
 
 		 294 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0886  HflC protein  38.04 
 
 		 340 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.340526 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  40.23 
 
 		 281 aa  186  4e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  36.04 
 
 		 300 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2735  protein hflC  38.71 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0491808  normal  0.0307139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  36.52 
 
 		 297 aa  186  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  38.41 
 
 		 295 aa  185  6e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  35.94 
 
 		 334 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  35.94 
 
 		 334 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  37.5 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  35.94 
 
 		 334 aa  183  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  36.18 
 
 		 297 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  36.52 
 
 		 297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  36.52 
 
 		 297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  35.22 
 
 		 335 aa  182  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  39.02 
 
 		 289 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0538  FtsH protease regulator HflC  35.48 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255691  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  33.92 
 
 		 303 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  38.02 
 
 		 289 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  36.3 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  35.02 
 
 		 331 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  35.33 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  34.98 
 
 		 286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  37.73 
 
 		 297 aa  178  8e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  37.32 
 
 		 289 aa  178  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  34.03 
 
 		 292 aa  176  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04042  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  36.96 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.040502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3818  HflC protein  36.96 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3838  FtsH protease regulator HflC  36.96 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  35.49 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4706  FtsH protease regulator HflC  36.96 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4733  FtsH protease regulator HflC  36.96 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04004  hypothetical protein  36.96 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  35.49 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  35.49 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4646  FtsH protease regulator HflC  36.96 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175793 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  35.49 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5691  FtsH protease regulator HflC  36.96 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4417  FtsH protease regulator HflC  36.96 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  38.21 
 
 		 293 aa  175  7e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  34.84 
 
 		 292 aa  175  8e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  36.5 
 
 		 292 aa  175  9e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  35.11 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>