More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0487 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  100 
 
 
283 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  57.95 
 
 
282 aa  359  3e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  60.07 
 
 
284 aa  351  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  57.5 
 
 
283 aa  348  5e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0264  HflC protein  58.06 
 
 
282 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  54.44 
 
 
282 aa  310  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  49.8 
 
 
300 aa  270  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  44.17 
 
 
290 aa  245  6.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  42.29 
 
 
300 aa  236  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  44.84 
 
 
293 aa  236  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  42.4 
 
 
300 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  41.64 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  41.34 
 
 
318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  41.64 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  42.53 
 
 
311 aa  232  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  40 
 
 
286 aa  231  8.000000000000001e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  40.28 
 
 
308 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  42.8 
 
 
312 aa  229  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  43.12 
 
 
289 aa  228  9e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  41.05 
 
 
325 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  44.24 
 
 
295 aa  227  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  39.58 
 
 
311 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  41.67 
 
 
295 aa  226  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  44.19 
 
 
283 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  42.61 
 
 
292 aa  225  5.0000000000000005e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  42.16 
 
 
299 aa  224  9e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  41.76 
 
 
298 aa  224  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  40.56 
 
 
316 aa  223  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  40.56 
 
 
313 aa  223  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  40.56 
 
 
320 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0002  HflC protein  42.41 
 
 
281 aa  221  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  39.26 
 
 
290 aa  221  9.999999999999999e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  42.36 
 
 
292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3523  HflC protein  39.54 
 
 
313 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  38.69 
 
 
289 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  38.21 
 
 
286 aa  219  5e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  39.16 
 
 
328 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  40.99 
 
 
281 aa  218  1e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0702  HflC protein  40.53 
 
 
310 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  42.05 
 
 
304 aa  215  7e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  41.24 
 
 
284 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  43.12 
 
 
293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  41.75 
 
 
293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  42.29 
 
 
294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  40.65 
 
 
297 aa  210  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3172  HflC protein  41.16 
 
 
300 aa  209  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  43.12 
 
 
293 aa  209  6e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  41.16 
 
 
302 aa  208  8e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0832  hflC protein  39.25 
 
 
290 aa  208  9e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.379816  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  43.36 
 
 
298 aa  208  9e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2263  HflC protein  37.67 
 
 
310 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00649366  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3614  HflC protein  40.42 
 
 
313 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  37.85 
 
 
297 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3679  HflC protein  40.42 
 
 
313 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  37.62 
 
 
334 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  37.62 
 
 
334 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  37.62 
 
 
334 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  36.34 
 
 
335 aa  206  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  42.91 
 
 
287 aa  205  8e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  38.79 
 
 
290 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  38.79 
 
 
290 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  38.19 
 
 
297 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  38.19 
 
 
297 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  38.19 
 
 
297 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4126  HflC protein  39.1 
 
 
320 aa  203  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  38.19 
 
 
297 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  41.6 
 
 
294 aa  202  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3385  HflC protein  39.84 
 
 
306 aa  202  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  41.54 
 
 
294 aa  202  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  37.85 
 
 
297 aa  202  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  37.85 
 
 
297 aa  202  5e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  37.5 
 
 
297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  39.08 
 
 
294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  41.72 
 
 
289 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  42.5 
 
 
289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02635  HflC protein  39.72 
 
 
282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  41.22 
 
 
287 aa  199  6e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0538  FtsH protease regulator HflC  36.16 
 
 
331 aa  199  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255691  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  40 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  35.67 
 
 
331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1786  integral membrane proteinase  38.63 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1721  HflC protein  38.63 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4782  FtsH protease regulator HflC  36.25 
 
 
334 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  0.242 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4632  FtsH protease regulator HflC  36.25 
 
 
334 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  35.67 
 
 
331 aa  196  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4761  FtsH protease regulator HflC  36.25 
 
 
334 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4642  FtsH protease regulator HflC  36.25 
 
 
334 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4725  FtsH protease regulator HflC  36.25 
 
 
334 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  41.13 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  37.59 
 
 
288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  42.91 
 
 
289 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  38.16 
 
 
295 aa  196  5.000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  37.06 
 
 
298 aa  195  6e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  38.25 
 
 
292 aa  195  6e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  43.45 
 
 
289 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  38.29 
 
 
292 aa  195  7e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  36.99 
 
 
292 aa  194  9e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3818  HflC protein  36.25 
 
 
334 aa  194  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3838  FtsH protease regulator HflC  36.25 
 
 
334 aa  194  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4733  FtsH protease regulator HflC  36.25 
 
 
334 aa  194  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>