More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1795 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1795  HflC protein  100 
 
 
300 aa  586  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1396  hflC protein  93.33 
 
 
300 aa  557  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685975  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1352  HflC protein  93.33 
 
 
300 aa  557  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2017  HflC protein  67.22 
 
 
310 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1748  HflC protein  70.29 
 
 
328 aa  376  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.224393  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2816  HFLC protein  63.57 
 
 
305 aa  371  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.273715  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2799  HflC protein  62.29 
 
 
321 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.565333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2540  HflC protein  61.67 
 
 
319 aa  361  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713322  normal  0.756997 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  45.52 
 
 
300 aa  240  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0923  putative HflC protein  44.86 
 
 
290 aa  238  9e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  44.79 
 
 
320 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  46.57 
 
 
311 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  44.44 
 
 
316 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  44.67 
 
 
311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  43.34 
 
 
318 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  44.44 
 
 
313 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  45.16 
 
 
298 aa  223  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  44.33 
 
 
300 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  44.67 
 
 
294 aa  223  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2735  protein hflC  45.52 
 
 
297 aa  221  8e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0491808  normal  0.0307139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  44.37 
 
 
308 aa  221  9e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  44.2 
 
 
299 aa  219  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  42.28 
 
 
328 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0356  HflC protein  43.55 
 
 
340 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.534146  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2000  HflC protein  43.55 
 
 
340 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0886  HflC protein  43.9 
 
 
340 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.340526 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  43.64 
 
 
312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  40.96 
 
 
325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  40.96 
 
 
290 aa  211  9e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  37.8 
 
 
292 aa  210  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3671  HflC protein  44.36 
 
 
369 aa  210  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150506  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  44 
 
 
295 aa  208  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  43.25 
 
 
293 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  37.63 
 
 
297 aa  206  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  40.82 
 
 
294 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  39.57 
 
 
284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  39.38 
 
 
293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  40.33 
 
 
302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3172  HflC protein  42.33 
 
 
300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  40.21 
 
 
289 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0702  HflC protein  42.8 
 
 
310 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  35.99 
 
 
295 aa  193  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  38.46 
 
 
300 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  40.49 
 
 
281 aa  189  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  39.86 
 
 
293 aa  189  7e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  38.78 
 
 
283 aa  187  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  41.91 
 
 
287 aa  186  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  37.72 
 
 
293 aa  186  6e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  38.41 
 
 
300 aa  186  6e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  38.79 
 
 
303 aa  185  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  38.38 
 
 
304 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  35.89 
 
 
289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  37.28 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  36.24 
 
 
290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  38.6 
 
 
289 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  38 
 
 
298 aa  183  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  38.25 
 
 
289 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  39.73 
 
 
292 aa  182  8.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  36.21 
 
 
289 aa  181  9.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  37.73 
 
 
287 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  38.19 
 
 
289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  37.68 
 
 
294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  36.21 
 
 
304 aa  179  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  36 
 
 
297 aa  179  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  35.52 
 
 
289 aa  179  5.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  37.85 
 
 
289 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  37.25 
 
 
283 aa  177  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  37.25 
 
 
283 aa  177  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  35.49 
 
 
288 aa  176  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  35.33 
 
 
297 aa  176  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  35.33 
 
 
297 aa  176  6e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  35.67 
 
 
297 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  34.47 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0638  HflC protein  39.22 
 
 
289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  35.64 
 
 
292 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  35.97 
 
 
295 aa  172  5.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  37.92 
 
 
289 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  32.31 
 
 
331 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  37.17 
 
 
289 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  32 
 
 
331 aa  170  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  32.27 
 
 
291 aa  169  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  34.25 
 
 
335 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  36.24 
 
 
295 aa  169  5e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  34.23 
 
 
308 aa  169  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0358  FtsH protease regulator HflC  32.29 
 
 
334 aa  168  8e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  hitchhiker  0.00397927 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04042  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  33.65 
 
 
334 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.040502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3818  HflC protein  33.65 
 
 
334 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  33.8 
 
 
286 aa  168  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4706  FtsH protease regulator HflC  33.65 
 
 
334 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4646  FtsH protease regulator HflC  33.65 
 
 
334 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.175793 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  35.14 
 
 
298 aa  168  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4733  FtsH protease regulator HflC  33.65 
 
 
334 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3838  FtsH protease regulator HflC  33.65 
 
 
334 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04004  hypothetical protein  33.65 
 
 
334 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5691  FtsH protease regulator HflC  33.65 
 
 
334 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4417  FtsH protease regulator HflC  33.65 
 
 
334 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  37.46 
 
 
289 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  33.79 
 
 
292 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  36.7 
 
 
295 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  37.81 
 
 
289 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>