More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1574 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  100 
 
 
300 aa  615  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  49.29 
 
 
284 aa  281  1e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  46.53 
 
 
282 aa  275  7e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  46.95 
 
 
300 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  47.76 
 
 
283 aa  270  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  49.21 
 
 
283 aa  269  4e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  46.64 
 
 
290 aa  267  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  44.21 
 
 
308 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  44.36 
 
 
298 aa  257  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  42.81 
 
 
318 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  43.98 
 
 
299 aa  251  7e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  47.04 
 
 
282 aa  250  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  43.17 
 
 
300 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  43.06 
 
 
311 aa  248  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  45.91 
 
 
311 aa  248  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  42.65 
 
 
295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  43.7 
 
 
312 aa  241  9e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  42.61 
 
 
293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  43.62 
 
 
328 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  43.22 
 
 
289 aa  239  4e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  43.97 
 
 
292 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0264  HflC protein  47.27 
 
 
282 aa  238  8e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0002  HflC protein  44.09 
 
 
281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  43.82 
 
 
325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  43.4 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  43.73 
 
 
294 aa  232  6e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  41.3 
 
 
284 aa  229  3e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0702  HflC protein  45 
 
 
310 aa  229  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  44.62 
 
 
304 aa  228  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  41.86 
 
 
295 aa  226  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  43.24 
 
 
283 aa  226  4e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  43.24 
 
 
283 aa  226  4e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  39.15 
 
 
286 aa  226  4e-58  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  38.1 
 
 
289 aa  224  1e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0832  hflC protein  40.59 
 
 
290 aa  224  2e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.379816  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  39.13 
 
 
290 aa  224  2e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  41.88 
 
 
320 aa  223  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  42.47 
 
 
316 aa  223  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  42.47 
 
 
313 aa  223  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  40.43 
 
 
294 aa  223  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  40.42 
 
 
293 aa  223  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  40.35 
 
 
302 aa  222  7e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  42.14 
 
 
293 aa  220  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  41.58 
 
 
294 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  40.59 
 
 
290 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  40.59 
 
 
290 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3385  HflC protein  37.69 
 
 
306 aa  212  5.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  40.54 
 
 
298 aa  212  7.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  39.29 
 
 
293 aa  210  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2000  HflC protein  38.83 
 
 
340 aa  208  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0356  HflC protein  38.83 
 
 
340 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.534146  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  42.7 
 
 
293 aa  207  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  36.82 
 
 
286 aa  206  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  38.83 
 
 
281 aa  206  3e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  40.08 
 
 
283 aa  207  3e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  42.86 
 
 
287 aa  206  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3523  HflC protein  38.46 
 
 
313 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0886  HflC protein  38.83 
 
 
340 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.340526 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  37.72 
 
 
297 aa  204  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  37.05 
 
 
281 aa  203  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02635  HflC protein  39.93 
 
 
282 aa  203  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  42.46 
 
 
289 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  38.89 
 
 
300 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  39.57 
 
 
292 aa  202  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2263  HflC protein  35.79 
 
 
310 aa  202  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00649366  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4126  HflC protein  40.68 
 
 
320 aa  202  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  40.14 
 
 
291 aa  202  7e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  39.24 
 
 
298 aa  201  9e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  42.46 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  40.82 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  44.02 
 
 
289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  43.97 
 
 
289 aa  199  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3172  HflC protein  39.04 
 
 
300 aa  200  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3614  HflC protein  38.25 
 
 
313 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  41.15 
 
 
287 aa  199  7e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  37.41 
 
 
297 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3679  HflC protein  38.52 
 
 
313 aa  198  9e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  37.32 
 
 
291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  38.81 
 
 
294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  37.41 
 
 
292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  43.48 
 
 
289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  38.43 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3671  HflC protein  37.73 
 
 
369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150506  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  43.48 
 
 
289 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  37.01 
 
 
288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  37.37 
 
 
297 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2735  protein hflC  37.02 
 
 
297 aa  195  8.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0491808  normal  0.0307139 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  37.76 
 
 
297 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  37.76 
 
 
297 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  36.65 
 
 
295 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  39.78 
 
 
292 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1396  hflC protein  37.93 
 
 
300 aa  192  8e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685975  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1352  HflC protein  37.93 
 
 
300 aa  192  8e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  38.11 
 
 
297 aa  192  8e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  38.73 
 
 
308 aa  191  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  38.81 
 
 
304 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  32.83 
 
 
334 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  32.83 
 
 
334 aa  190  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  32.83 
 
 
334 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  36.65 
 
 
292 aa  190  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>