More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2023 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  100 
 
 
292 aa  576  1.0000000000000001e-163  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  47.22 
 
 
308 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  46.88 
 
 
318 aa  268  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  47.06 
 
 
311 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  44.64 
 
 
300 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  47.74 
 
 
290 aa  259  4e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  48.13 
 
 
298 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  46.4 
 
 
311 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  45.85 
 
 
299 aa  252  6e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  46.62 
 
 
300 aa  247  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  46.23 
 
 
320 aa  246  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  47.08 
 
 
312 aa  246  4e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  46.23 
 
 
316 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  46.23 
 
 
313 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  43.99 
 
 
328 aa  240  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  44.1 
 
 
325 aa  238  8e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  47.16 
 
 
281 aa  237  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  45.42 
 
 
295 aa  232  4.0000000000000004e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  42.2 
 
 
282 aa  229  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0702  HflC protein  46.24 
 
 
310 aa  229  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  44.28 
 
 
300 aa  228  8e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  40.14 
 
 
290 aa  226  2e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  39.3 
 
 
289 aa  227  2e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  45.26 
 
 
293 aa  226  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  41.61 
 
 
283 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  43.39 
 
 
294 aa  222  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  44.4 
 
 
283 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  43.45 
 
 
302 aa  217  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  40.35 
 
 
284 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  41.54 
 
 
282 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  41.55 
 
 
284 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2735  protein hflC  43.55 
 
 
297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0491808  normal  0.0307139 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  42.37 
 
 
289 aa  212  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  40.34 
 
 
297 aa  209  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2000  HflC protein  42.21 
 
 
340 aa  208  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0356  HflC protein  42.21 
 
 
340 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.534146  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  41.3 
 
 
293 aa  206  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  38.43 
 
 
286 aa  206  3e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  40.75 
 
 
283 aa  205  8e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  43 
 
 
298 aa  205  9e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0264  HflC protein  42.03 
 
 
282 aa  204  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  37.24 
 
 
295 aa  203  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  40.86 
 
 
304 aa  203  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  42.76 
 
 
291 aa  203  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  38.25 
 
 
292 aa  202  5e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  36.36 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0886  HflC protein  42.61 
 
 
340 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.340526 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  36.36 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  37.28 
 
 
281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0832  hflC protein  39.78 
 
 
290 aa  199  3.9999999999999996e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.379816  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3172  HflC protein  40.56 
 
 
300 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  38.43 
 
 
294 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  34.9 
 
 
294 aa  192  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  35.25 
 
 
293 aa  192  7e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  39.35 
 
 
287 aa  190  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  36.27 
 
 
297 aa  190  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  38.85 
 
 
300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  37.94 
 
 
295 aa  189  5.999999999999999e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0549  membrane protease subunit HflC  37.82 
 
 
304 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3523  HflC protein  38.11 
 
 
313 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02635  HflC protein  39.1 
 
 
282 aa  187  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0525  membrane protease subunit HflC  37.82 
 
 
304 aa  186  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3385  HflC protein  39.62 
 
 
306 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  38.06 
 
 
291 aa  186  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  35.84 
 
 
297 aa  186  6e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  35.84 
 
 
297 aa  186  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3015  HflC protein  40.07 
 
 
287 aa  185  7e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.698845  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1786  integral membrane proteinase  37.54 
 
 
287 aa  185  7e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3671  HflC protein  41.76 
 
 
369 aa  185  9e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150506  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  38.04 
 
 
294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  33.9 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1721  HflC protein  37.54 
 
 
287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  37.41 
 
 
293 aa  183  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3679  HflC protein  38.1 
 
 
313 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  35.25 
 
 
298 aa  183  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  34.81 
 
 
297 aa  183  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_004310  BR1396  hflC protein  39.8 
 
 
300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685975  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1352  HflC protein  39.8 
 
 
300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2799  HflC protein  39.66 
 
 
321 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.565333 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  39.85 
 
 
287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3614  HflC protein  38.44 
 
 
313 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  37.29 
 
 
293 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  36.68 
 
 
303 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  38.73 
 
 
289 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  33.64 
 
 
335 aa  179  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  38.03 
 
 
289 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  35.52 
 
 
292 aa  178  9e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  36 
 
 
295 aa  178  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  37.06 
 
 
286 aa  177  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  41.2 
 
 
289 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  35.05 
 
 
297 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0002  HflC protein  33.84 
 
 
281 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  35.05 
 
 
297 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1795  HflC protein  39.37 
 
 
300 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  35.05 
 
 
297 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  35.05 
 
 
297 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  40.85 
 
 
289 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2540  HflC protein  38.85 
 
 
319 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713322  normal  0.756997 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  35.4 
 
 
304 aa  175  9e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  34.16 
 
 
334 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>